寫在前面 生物信息數(shù)據(jù)下游分析，是一個(gè)非常復(fù)雜，且?guī)缀鯖]有也不可能流程化的操作桩警。究其原因，但凡貼近生物學(xué)問題鸿捧，需要更多生物學(xué)視角嗤军，甚至是研究人員...

在基因家族分析中靶瘸，關(guān)于功能域可視化是一個(gè)相對(duì)比較簡(jiǎn)單的流程式方法寝优。能夠較好地了解不同物種間同一個(gè)家族結(jié)構(gòu)域的保守和差異情況条舔。單純進(jìn)行可視化的方法...

本文章將介紹 ①類blast軟件blast迁杨、mmseqs、diamond夸浅、hmmer的比較 ②blast仑最、mmseqs扔役、diamond帆喇、hmme...

一、基因家族基礎(chǔ)知識(shí)與研究思路介紹 1.基因家族簡(jiǎn)介 基因是染色體上一段可以發(fā)生轉(zhuǎn)錄的區(qū)域（內(nèi)含子外顯子啟動(dòng)子）亿胸。轉(zhuǎn)錄本才是基因的研究實(shí)體坯钦，轉(zhuǎn)錄...

遇到的問題：fungene上的氮循環(huán)基因narG.hmm數(shù)據(jù)太老 http://fungene.cme.msu.edu/ 如圖共5條序列，一致的...

包括基因成員的序列特征分析（分子量等電點(diǎn)等）基于motif分析成員序列保守特征與可視化（蛋白與核酸侈玄，可用于挖掘未知婉刀，尤其是核酸水平-非編碼水平的...

寫在前面：非常感謝CJ開發(fā)出如此強(qiáng)大的TBtools工具，作者詳細(xì)講解了基因家族的分析過程和意義序仙，課程購買地址突颊，講的很棒，可以試聽潘悼。 一共分為4...

方法一：基于hmm模型的鑒定方法 1.準(zhǔn)備數(shù)據(jù)①下載擬南芥基因組fasta文件律秃、注釋文件gtf/gff3文件：ftp://ftp.ensembl...

此版本為無代碼版本，依賴tbtools來實(shí)現(xiàn)治唤，純粹記錄自己的學(xué)習(xí)經(jīng)驗(yàn)棒动。 蛋白序列的blast比對(duì) 選擇擬南芥基因家族的蛋白序列文件 選擇你想要查...