轉(zhuǎn)錄組學 - 專題

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動物轉(zhuǎn)錄因子注釋和預測
轉(zhuǎn)錄因子(Transcription factors, TFs)作為轉(zhuǎn)錄調(diào)控的重要組成部分，鑒定颈娜、分類和注釋轉(zhuǎn)錄因子以及分析轉(zhuǎn)錄因子的調(diào)控和功能...

0.7 多啦A夢的時光機_648d 0 8
RNA-seq入門實戰(zhàn)（六）：GO扎酷、KEGG富集分析與enrichplot超全可視化攻略
本節(jié)概覽：1.獲取DEG結(jié)果的上下調(diào)差異基因2.bitr()函數(shù)轉(zhuǎn)化基因名為entrez ID3.利用clusterProfiler進行KEGG...

5.1 嘿嘿嘿嘿哈 5 59

單細胞數(shù)據(jù)科學四大過程組兩大知識領域與三重境界
很多朋友問是如何保持閱讀量的辐啄，其實楣导，大部分是之前的存貨烦租。有一部分是每有會意豺鼻，把之前的舊書拿出來再翻一翻沫勿，做個導圖放上來的挨约。今天，我想和大家分享一...

1.2 周運來就是我 2 16
一行命令完成RNAseq差異分析+火山圖+散點圖
今天來給大家分享的是：怎么一行命令完成RNAseq數(shù)據(jù)差異分析+火山圖+散點圖产雹。一诫惭、準備3個文件： 1、基因表達count文件：gene_co...

1.7 鄧老師呦 2 27
【RNA-seq自學10】總結(jié)篇
1蔓挖、什么情況下用RNAseq RNAseq是一種高通量測序技術夕土。它可以幫助我們理解在各種比較條件下，所有基因的表達情況的差異瘟判。簡單的理解怨绣，就是R...

9.2 Brickvstar 1 84
蛋白三級結(jié)構(gòu)預測（I TASSER）
獻給初學者：手把手教你在線預測蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)I TASSER算是比較好的華人教授開發(fā)的一個預測軟件，在線可以直接分析拷获。但是需要等待挺長時間并且一次只...

落寞的橙子 2 0
基于short reads的結(jié)構(gòu)變異鑒定工具的綜合評價
本文的部分內(nèi)容來源于“Comprehensive evaluation and characterisation of short read g...

1.6 Boer223 0 14

2020-02-11 eggnog-mapper的使用及結(jié)果
序自《2020-02-08 wget（含參數(shù)技巧）下載eggNOG數(shù)據(jù)庫篮撑、安裝以及碰到的問題》一、使用 1匆瓜、數(shù)據(jù)庫內(nèi)容在下載好eggnog數(shù)...

暮色下的煙波瀾 2 1
【HMMSCAN】使用pfam數(shù)據(jù)庫對多序列文件進行結(jié)構(gòu)域注釋
寫在前面做基因功能的人都會特別注意基因上有什么功能結(jié)構(gòu)域赢笨，通常我們認為未蝌，結(jié)構(gòu)域決定了這個基因的功能。隨著高通量測序技術的發(fā)展茧妒，我們完全可以通過...

2.4 鞏翔宇Ibrahimovic 4 20
BSgenome構(gòu)建新的參考基因組
目標 BSgeome自己有很多構(gòu)建好的基因組萧吠，但是對于非模物種來說，有時候我們需要自己構(gòu)建基因組的信息嘶伟。如何根據(jù)物種的參考基因組fa文件怎憋，構(gòu)建新...

0.4 果蠅的小翅膀 4 5