你又是什么測(cè)序 - 專(zhuān)題

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GO富集可視化：clusterProfiler+GOplot
現(xiàn)在的社會(huì)正處于大數(shù)據(jù)時(shí)代堆生，生物學(xué)研究領(lǐng)域也迎來(lái)了大組學(xué)時(shí)代。無(wú)論是植物瘪板。動(dòng)物，還是微生物漆诽，都有許多物種被測(cè)序侮攀。在后續(xù)的個(gè)性化分析過(guò)程中，通常會(huì)...

6.7 Mr_我愛(ài)讀文獻(xiàn) 12 67
使用wgd進(jìn)行全基因組復(fù)制分析
這篇教程是我在2019年9月左右分析WGD時(shí)的筆記厢拭。目前來(lái)看兰英，背景介紹和軟件使用說(shuō)明都基本沒(méi)啥問(wèn)題。但是現(xiàn)在更建議大家使用wgdi進(jìn)行比較基因組...

5.2 xuzhougeng 5 57

統(tǒng)計(jì)測(cè)序結(jié)果中比對(duì)到基因不同部分（如UTR,Exon,Intron...）情況
### Qualimap .... ###GenomicFeatures (R包) GenomicFeatures ### RSeQC http...

0.2 生信石頭 0 2
GSEA學(xué)習(xí)筆記
春節(jié)后的第一次寫(xiě)學(xué)習(xí)筆記供鸠，還是要提醒大家沒(méi)事別聚集畦贸、別聚集、別聚集楞捂！重要的事情說(shuō)三遍薄坏！前幾天看到公眾號(hào)里寫(xiě)了GSEA的文章，雖然我之前跟著很多...

3.9 生信start_site 11 71
R包——Mutational Pattern
介紹背景介紹細(xì)胞的基因組不斷受到內(nèi)源性和環(huán)境性dna損傷的威脅寨闹，例如紫外線和自發(fā)反應(yīng)胶坠。為了維護(hù)它們的基因組完整性，細(xì)胞利用各種機(jī)制修復(fù)受損的...

3.0 oddxix 14 38
基因家族分析
1 介紹 · 基因家族（Gene family）繁堡，是來(lái)源于同一個(gè)祖先沈善，由一個(gè)基因通過(guò)基因復(fù)制或者加倍而產(chǎn)生兩個(gè)或更多的拷貝而構(gòu)成的一組基因，它...

4.3 nnlrl 9 78
SNP功能注釋網(wǎng)站合集
這篇文章是對(duì)SNP位點(diǎn)功能注釋在線網(wǎng)站的一個(gè)總結(jié)帖帖蔓。軟件排名不分先后矮瘟，優(yōu)先順序可以看推薦指數(shù)。彩蛋在最后塑娇，請(qǐng)堅(jiān)持看完 1、GWAS4D, 推...

8.3 橙子牛奶糖 1 69

簡(jiǎn)單易懂的在線網(wǎng)站datamonkey：支系劫侧、基因埋酬、位點(diǎn)的選擇壓力檢測(cè)
歡迎來(lái)到"bio生物信息"的世界今天哨啃，為大家?guī)?lái)一個(gè)在線網(wǎng)站datamonkey，可以同時(shí)檢測(cè)支系写妥、基因拳球、位點(diǎn)的選擇壓力。 datamonke...

0.5 橙子牛奶糖 0 7
從fastq數(shù)據(jù)到SNV | GATK
00 寫(xiě)在前面僅針對(duì)人類(lèi)WGS或WES數(shù)據(jù)珍特，供參考祝峻。時(shí)間管理某一點(diǎn)：能自動(dòng)化的工作盡量自動(dòng)化，不要時(shí)間用在毫無(wú)意義的重復(fù)上扎筒。腦袋好比肌肉莱找，需要...

3.5 fatlady 23 54
gatk4 mutect2 分析somatic突變
第一步：創(chuàng)建normal樣品的PoN（Create a sites-only PoN with CreateSomaticPanelOfNorm...

0.5 微笑life 1 8