VCF文件的變異分布圖帮非，除了使用Circos圖之外婆廊，統(tǒng)計特定材料間的變異分布情況時可能會用到染色體分布圖裹赴，為了節(jié)省時間报腔，實現(xiàn)統(tǒng)計及繪圖的自動化蜈彼，...
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VCF變異統(tǒng)計及繪制染色體分布圖 -
SURVIVOR 合并不同的SV
SURVIVOR 用于模擬/評估 SV、合并和比較樣本內(nèi)及樣本間 SV 的工具集总滩。 githup: https://github.com/fri...
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「生信」共線性分析——MCScanX目錄MCScanX下載及安裝數(shù)據(jù)準備MCScanX運行及結(jié)果Ka & Ks 計算下游畫圖腳本最后 MCScanX有兩個主要的功能, 一是, 方便...
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MUMandCo軟件的使用寫在開頭 ????因為一直在進行call SVs的課題纲堵，收集了一些相關(guān)軟件，今天給各位介紹一款2020年5月份發(fā)布的MUMandCo闰渔，也可以寫作...
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應該是最新最詳細的MUMmer中文使用說明如何使用MUMmer比對大片段序列 測序技術(shù)剛開始發(fā)展的時候席函，大家得到的序列都是單個基因的長度，所以一般都是逐個基因的比較澜建，用的都是BLAST或...
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參加2019-PGC-XX的些許感想前幾日隨同課題組部分成員一起去參加了第二十屆全國植物基因組學大會（PGC-XX）向挖。此次大會邀請了國內(nèi)外植物基因組學相關(guān)領域的近40位報告人，分為...
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【SV分析】01怎么下載物種的contig數(shù)據(jù)
因為小編之前做過一段時間的SV分析炕舵，所以想在此分享一下做SV分析的過程。 今天先介紹如何下載物種的contig數(shù)據(jù)跟畅？這是SV分析的第一步咽筋。 這里...
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【SV分析】02如何使用smartie-sv Calling SV
上一次小編介紹了如何下載物種的contig數(shù)據(jù)，沒看過的小伙伴可以點擊以下鏈接：http://www.reibang.com/p/081046...
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【SV分析】03如何安裝smartie-sv
前言 在后臺小伙伴的催促下徊件，小Q終于把拖欠了N久的第3篇SV分析--軟件安裝篇寫完了奸攻。廢話不多說蒜危。 內(nèi)容目錄 預安裝依賴軟件 1.安裝Minic...
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