關(guān)于測序的背景與實驗 - 專題

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收錄了20篇文章 · 14人關(guān)注

WGBS 下游處理-Package methylKit
1.1 我們要將上游處理得到的the methylation call files轉(zhuǎn)換為methylKit這個R包可以識別的格式該文作者寫了三...

0.8 桁_COLA 0 7
Whole Genome DNA Methylation Analysis Pipeline 第一部分（上游處理-MethPipe）
一瞒大、介紹首先聲明，本文注重流程的梳理和生物學(xué)意義的解答俊性，具體軟件的原理和參數(shù)的運(yùn)用請參照MethPipe軟件手冊（和我未來的翻譯）本文使用B...

0.9 桁_COLA 0 4

人基因組版本的對應(yīng)關(guān)系：演變的記錄
我經(jīng)常需要復(fù)習(xí)版本對應(yīng)的時候來看這個略步；希望對你也有幫助 From 諶于藍(lán)：2019.9

0.2 Amy_Cui 0 1
利用plink對snp質(zhì)控的指標(biāo)和基本流程
在拿到一組snp數(shù)據(jù)時，首先應(yīng)該想到要對snp數(shù)據(jù)的質(zhì)量進(jìn)行檢測和控制定页。然后再考慮這組數(shù)據(jù)該怎么分析趟薄，如何分析。snp的質(zhì)控是非常重要的典徊，如果s...

1.3 要快樂_更要經(jīng)歷山河 1 25
GATK-參數(shù)
我應(yīng)該如何正確設(shè)置GATK VQSR的模型訓(xùn)練參數(shù)杭煎？ | 《解螺旋技術(shù)交流圈》精華第4期堿基礦工2018-07-29 今天，只分享一個精選內(nèi)容...

0.3 耕讀者 0 4
【文獻(xiàn)】單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)與生物信息流程綜述
【文獻(xiàn)】Single-cell RNA sequencing technologies and bioinformatics pipelines...

2.4 11的霧 0 33 1
詳解如何獲取物種所有基因?qū)?yīng)的GO注釋
歡迎關(guān)注”生信修煉手冊”! Gene Ontology是研究基因功能的重要數(shù)據(jù)庫之一卒落，在進(jìn)行GO的富集分析時羡铲，需要提供所有基因?qū)?yīng)的GO注釋信息...

1.5 生信修煉手冊 3 30

[數(shù)據(jù)庫] KEGG
KEGG 參考資料：5分鐘看懂KEGG代謝通路圖讀研筆記: KEGG學(xué)習(xí)筆記GEO數(shù)據(jù)挖掘小嘗試：（三）利用clusterProfiler進(jìn)行富...

1.8 happyxhz 0 5
MethyIC-Seq是什么？和BS-Seq的關(guān)系是什么儡毕？
從根本上說也切，MethylC-Seq技術(shù)實際上就是Bisulfite Sequencing (BS-Seq)方法的優(yōu)化版本⊙澹或者談不上優(yōu)化雷恃，個人理...

0.8 桁_COLA 0 6
Bioconductor做生信分析入門介紹（上）
這是我聽B站鯪魚不會飛視頻（R與Bioconductor的入門課）里的筆記哦~ Bioconductor是什么？ Bioconductor是一個...

4.9 黃晶_id 4 108