導(dǎo)讀 關(guān)于如何將差異分析所得（上調(diào)或者下調(diào)）的代謝物進行KEGG通路的一個展示趟卸，除了利用大家熟知的Metaboanalyst[1]殖妇，以及R軟件包...

各個軟件列表和優(yōu)缺點如下： 1、XCMS XCMS是2006年發(fā)布的、基于R語言的用于LC-MS數(shù)據(jù)處理分析的軟件[2]畏陕。該軟件是命令行驅(qū)動的拓劝，...

MSEA 什么是MSEA MSEA，Metabolite Set Enrichment Analysis踱卵，代謝集富集分析廊驼，是代謝組數(shù)據(jù)分析方法的...

導(dǎo)讀 通路富集分析技術(shù)對于理解代謝組學(xué)數(shù)據(jù)背后的潛在生物學(xué)意義是非常有用的据过，它們的目的是根據(jù)代謝途徑中所包含的先驗知識，為受影響的代謝物提供上下...

非靶向代謝組實驗設(shè)計 1.代謝物提取妒挎，一般要求每組至少10個樣绳锅；2.在所有提取好的樣本中取等量混合作為QC；3.QC樣本與實驗樣本穿插上機酝掩，開始...

Create test data Now plot Order levels 鏈接地址：http://blog.sciencenet.cn/bl...

一：創(chuàng)建矩陣： # Create test matrixtest = matrix(rnorm(200), 20, 10)test[1:10, ...

感覺100年沒有上簡書，近2個月忙于畢業(yè)論文以及公眾號推文期虾，沒有時間更文章积蜻。終于前幾天交了論文呢，可以回來更文了彻消。沒錯我只是在為我的懶惰尋找接口...

環(huán)境：R_x64_4.0.2 & RStudio_1.2.1335相比網(wǎng)站生成火山圖竿拆，使用R語言生成火山圖可以滿足更多的要求，但相關(guān)文章不甚清晰...

火山圖 火山圖用于展示基因表達差異的分布宾尚，橫軸為Log2 Fold Change丙笋，越偏離中心差異倍數(shù)越大；縱軸為(-1)*Log10 P_adj...