do.call這個(gè)函數(shù)是我在搜索問(wèn)題時(shí)會(huì)看到別人經(jīng)常使用的一個(gè)函數(shù)榛搔，心生好奇蛾洛，這次來(lái)看看它的用法操刀。 從文檔來(lái)看眼耀，do.call可以通過(guò)名字構(gòu)建和...
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【r<-函數(shù)】do.call的使用
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你到底想要什么樣的umap/tsne圖较雕？隨著生物學(xué)背景知識(shí)的增加结执，單細(xì)胞圖譜的可視化直接用10X的Loup或者seurat的Dimplot函數(shù)直接繪制的umap/tsne圖往往很難達(dá)到...
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繼續(xù)來(lái)看pheatmap那些有趣的事情劉小澤寫于2020.5.18上次看了熱圖如何去掉聚類樹的同時(shí)保留聚類的順序 ，有朋友留言給出了其他的解決方法蔽介，非常感謝摘投！文中會(huì)給出答案另外煮寡，這次...
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R語(yǔ)言常用的數(shù)據(jù)處理的包(2)
這一節(jié)我們來(lái)復(fù)習(xí)一下shape2的用法：reshape2包的主要功能函數(shù)是melt（）和cast（），其實(shí)現(xiàn)了長(zhǎng)數(shù)據(jù)和寬數(shù)據(jù)之間的轉(zhuǎn)換犀呼。 mel...
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R循環(huán)畫圖
1.R畫圖 R是我們做生信進(jìn)行圖形展示較為常用的軟件幸撕，我們?cè)诮?jīng)常使用R進(jìn)行數(shù)據(jù)展示，畫一個(gè)或者幾個(gè)圖圆凰，但我們做生信的杈帐，批量化是我們最重要的目標(biāo)之...
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heatmap由于有太多NA無(wú)法聚類原因和解決方法有的時(shí)候數(shù)據(jù)中有NA体箕，可以聚類出來(lái)专钉，但是有的時(shí)候就會(huì)報(bào)一個(gè)這樣的錯(cuò)誤：“Error in hclustfun(distfun(x)) : NA/...
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推薦一些配色的網(wǎng)站推薦一些好用的配色網(wǎng)站 可以選擇不同色系的網(wǎng)站：https://www.toodoo.com/db/color.html http://www....
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手把手演示R語(yǔ)言繪制多個(gè)基因表達(dá)值小提琴圖數(shù)據(jù)準(zhǔn)備 整合小提琴圖 小提琴圖DCIS VS. IBC/N 小提琴圖DCISS VS. IBCS/NS 箱線圖
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R 語(yǔ)言配色收集今天（2020-0430）逛twitter 時(shí)候看到一個(gè)唐大佬的帖子：do you really understand heatmaps? 中...
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ggplot2繪圖學(xué)習(xí)-箱線圖和小提琴圖最近考種數(shù)據(jù)回來(lái)了，今年測(cè)得單株累铅，本想用箱線圖表示跃须，后來(lái)一并把小提琴圖也做了，順便做個(gè)筆記吧娃兽。 利用SUMIF對(duì)相同rowname數(shù)據(jù)合并 首先...
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