通俗統(tǒng)計(jì)之——如何計(jì)算統(tǒng)計(jì)功效（部分內(nèi)容受教于網(wǎng)絡(luò)毡证，經(jīng)個(gè)人理解闡述于此跃脊，不限版權(quán)疟丙，盡管轉(zhuǎn)載） 1. 何為‘統(tǒng)計(jì)功效’讥此？ 統(tǒng)計(jì)功效攒岛，是用來描述舆绎，在...
0.輸入文件和R包 文件有兩個(gè)，一個(gè)是差異分析結(jié)果秸歧；一個(gè)是msigdb數(shù)據(jù)庫下載的gmt文件厨姚。 gsea要求的輸入數(shù)據(jù)格式是排序后的logFC值...
之前我們提到了如果做多次的假設(shè)檢驗(yàn)，就要考慮多重比較矯正的問題了键菱。那有沒有只用做一次檢驗(yàn)就可以搞定的方法呢谬墙。其實(shí)是有的，就是方差分析（ANOVA...
最近文章被拒经备，原因是使用了錯(cuò)誤的統(tǒng)計(jì)方法拭抬。我在文章中使用的是One-Way ANOVA，而編輯指出應(yīng)該改用Orthogonal contr...
R語言學(xué)習(xí)資料搜集：原文鏈接 最近被各種ANOVA搞得頭暈侵蒙，在這里稍微總結(jié)一下造虎。 Mixed-degin ANOVA是什么？什么情況使用它纷闺？要了...
貝葉斯方法把計(jì)算“具有某特征的條件下屬于某類”的概率轉(zhuǎn)換成需要計(jì)算“屬于某類的條件下具有某特征”的概率算凿，屬于有監(jiān)督學(xué)習(xí)。樸素貝葉斯這種學(xué)習(xí)方法是...
Chapter 9 Linear Regression 本篇是第九章犁功，內(nèi)容是回歸分析（主要以線性回歸為主）氓轰。回歸分析是數(shù)理統(tǒng)計(jì)浸卦、數(shù)理分析中最基礎(chǔ)...
什么是組間差異檢驗(yàn)？就是組間的差異分析以及顯著性檢驗(yàn)限嫌，應(yīng)用統(tǒng)計(jì)學(xué)上的假設(shè)檢驗(yàn)方法靴庆，檢驗(yàn)組間是否有差異及其差異程度。坦率地講萤皂，所有的差異檢驗(yàn)都基于...
一裆熙、p-value相關(guān) 0. 單個(gè)假設(shè)檢驗(yàn)中主要依靠p值(或統(tǒng)計(jì)量t)做出是否拒絕零假設(shè)H0的決定：p-value和預(yù)先設(shè)定的檢驗(yàn)水準(zhǔn)alpha...
方差分析主要通過F檢驗(yàn)來進(jìn)行效果評測端礼，若治療方案的F檢驗(yàn)顯著，則說明檢驗(yàn)樣本組間均值不同入录。 ANOVA模型擬合 從函數(shù)形式上看蛤奥，ANOVA和回歸...
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