生物信息學(xué)小站 - 專題

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生物信息學(xué)小站

收錄了8篇文章 · 44人關(guān)注

使用泊松分布判定chipseq的蛋白結(jié)合位點
二項分布和泊松分布都描述的是事件成功次數(shù)的分布佛嬉，泊松分布是二項分布的極限分布蛉迹，其適用條件是n很大稠诲，p很小的情況舵匾。生物學(xué)中一些過程可以使用二項分布...

0.6 BryceBryce 0 5
使用viz-palette可視化你的配色方案
數(shù)據(jù)分析時我們經(jīng)常會遇到多組treatment和control诬乞，多個細(xì)胞系册赛，多種組學(xué)數(shù)據(jù)類型的情況，用ggplot或者matplotlib作圖時...

BryceBryce 0 4

R語言 | 用image函數(shù)繪制熱圖heatmap
R語言中繪制熱圖heatmap的包（package）有很多震嫉，除了許多炫酷的第三方包外森瘪，系統(tǒng)自帶的image函數(shù)使用起來也十分方便靈活。 1.主要...

BryceBryce 0 3
RegulomeDB和HaploReg數(shù)據(jù)庫：后GWAS時代的數(shù)據(jù)整合
RegulomeDB和HaploReg數(shù)據(jù)庫提供了將大量基因組學(xué)數(shù)據(jù)與非編碼突變整合的思路票堵。 1.背景 GWAS研究產(chǎn)生了大量的SNP扼睬，大部分在...

0.5 BryceBryce 0 8
使用REST API批量下載ENCODE數(shù)據(jù)
本篇主要內(nèi)容本篇主要介紹兩種方法，搜索并批量下載ENCODE數(shù)據(jù)悴势。方法一：在頁面中搜索并獲取下載地址進(jìn)入ENCODE portal主頁：h...

0.6 BryceBryce 0 6
玩轉(zhuǎn)ENCODE項目的數(shù)據(jù)資源（一）
本系列主要內(nèi)容介紹ENCODE的數(shù)據(jù)概況窗宇，在data portal上查詢數(shù)據(jù)，使用REST API批量下載數(shù)據(jù)特纤，參照ENCODE官方數(shù)據(jù)處理流...

1.0 BryceBryce 3 12
基因組學(xué)數(shù)據(jù)分析常用的在線資源
奮斗在人類組學(xué)數(shù)據(jù)分析的一線军俊，要隨時跟上最新的研究進(jìn)展。大型的研究項目會有全面的數(shù)據(jù)集和可視化工具捧存，也有專門從各個數(shù)據(jù)源收集數(shù)據(jù)整合而成的數(shù)據(jù)庫...

0.9 BryceBryce 2 24

生物信息工程師的編程語言清單
作為一名生物信息“工程師”粪躬，日常的工作環(huán)境是基于Unix的計算機集群，因此最常用的就是shell腳本昔穴。它可以簡單的處理數(shù)據(jù)镰官，再加上迷你語言sed...

0.1 BryceBryce 0 5