生物信息學(xué)與基因組學(xué) - 專題

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讀李霞老師《生物信息學(xué)》教材
第一次知道李霞老師是在2019年“數(shù)學(xué)核畴、計(jì)算機(jī)與生命科學(xué)交叉科學(xué)青年學(xué)者論壇”上脯宿，詳見：2019||數(shù)學(xué)亩进、計(jì)算機(jī)與生命科學(xué)交叉科學(xué)青年學(xué)者論壇。...

0.4 周運(yùn)來就是我 0 7
經(jīng)典：基因組測序數(shù)據(jù)從頭拼接或組裝算法的原理
原作者：https://www.cnblogs.com/aipufu/p/11596253.html https://www.cnblogs.c...

4.4 無理取now 1 30

生成特定堿基比例的隨機(jī)序列
???#!/usr/bin/perl use strict; use warnings; use BioX::SeqUtils::RandomS...

0.2 dulunar 0 2
【現(xiàn)學(xué)現(xiàn)賣·自學(xué)生信】鏈霉菌的全基因組分析（1）
Complete genome sequences ofStreptomyces spp. isolated from disease supp...

3.3 番茄隨筆 0 5
回顧 | 系統(tǒng)進(jìn)化樹構(gòu)建的常見方法
構(gòu)建進(jìn)化樹的方法主要分為距離矩陣法（含 UPGMA膨俐、ME勇皇、NJ等）最大簡約法（MP）極大似然法（ML）貝葉斯法（Bayesian）基于...

1.6 生信石頭 0 7
「來繪圖吧！」鏈特異性測序的read depth繪制
以釀酒酵母為例吟策，用到的數(shù)據(jù)如下儒士，隨便找一個(gè)鏈特異性測序的fastq用常見比對軟件跑一下都行。有一些數(shù)據(jù)我放在github檩坚，可參考：https:/...

0.7 陳有樸 2 6
你真的搞懂測序技術(shù)了嗎——第二代測序
本文首發(fā)于“生信大碗”公眾號着撩，轉(zhuǎn)載請注明出處之前我們講了測序以及第一代測序技術(shù)，還沒看的小伙伴可以先去補(bǔ)補(bǔ)課（你真的搞懂測序技術(shù)了嗎——測序匾委、...

1.3 生信大碗 2 12

機(jī)器學(xué)習(xí)入門總結(jié)和各類常用神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)匯總(第一篇)
這里總結(jié)了李宏毅老師的機(jī)器學(xué)習(xí)的課程拖叙。首先我們將會了解到機(jī)器學(xué)習(xí)的概念，但是課程的主要觀點(diǎn)將會聚焦到Deep Learning赂乐。進(jìn)行了解之后我們...

5.4 小黃不頭禿 0 25
表達(dá)質(zhì)粒構(gòu)建之引物設(shè)計(jì)
比如我現(xiàn)在需要表達(dá)FUS這個(gè)蛋白薯鳍，首先我要確定FUS的CDS區(qū)序列，使用NCBI即可獲得挨措；可以看出FUS有三個(gè)同源異構(gòu)體挖滤，我們以第一個(gè)X1為例...

1.3 找兔子的小蘿卜 5 7
計(jì)算分子進(jìn)化-搞懂PAML的正選擇分析
許多基因組的文章里都會提到使用PAML進(jìn)行基因的正選擇分析(positive selection), 網(wǎng)上也有一些教程介紹如何用PAML進(jìn)行分析...

4.5 xuzhougeng 2 47