首先得到每條序列的長(zhǎng)度沪饺，在這里使用seqkit軟件球切。seqkit軟件是一個(gè)強(qiáng)大的序列處理工具畴椰，安裝方法參見(jiàn)官方網(wǎng)站.代碼如下： 結(jié)果如下所示： ...

參考這篇ID轉(zhuǎn)換不用怕抛腕，clusterProfiler幫你忙這篇詳細(xì)講了無(wú)參考基因組該怎么辦项乒，值得一看 簡(jiǎn)單介紹一下幾種常用的ID：Ensemb...

劉小澤寫于2020.5.28Ensemble轉(zhuǎn)Symbol其實(shí)不是這么簡(jiǎn)單服赎，問(wèn)題百出葵蒂，需要留意 0 今天遇到一個(gè)需求，先來(lái)看看 有這樣的四個(gè)文件...

雙序列局部比對(duì)的算法和全局比對(duì)算法的步驟相似重虑，只是賦值規(guī)則稍有不同践付，每個(gè)單元格的分值由前面對(duì)角線的分值和引入一個(gè)空位得到的分值的最大值決定，但是...

0. 簡(jiǎn)介 這篇文章是發(fā)表在Nature Methods上的使用深度學(xué)習(xí)來(lái)擴(kuò)充可變剪切的分析缺厉。通訊作者是來(lái)自于UCLA的邢毅老師永高。這篇文章創(chuàng)新點(diǎn)...

這篇文章是對(duì)SNP位點(diǎn)功能注釋在線網(wǎng)站的一個(gè)總結(jié)帖隧土。 軟件排名不分先后，優(yōu)先順序可以看推薦指數(shù)命爬。 彩蛋在最后曹傀，請(qǐng)堅(jiān)持看完 1、GWAS4D, 推...

導(dǎo)讀 宏基因組分析分為物種分析和功能分析兩大塊艇抠。物種組成分析是物種分析中最基本最常見(jiàn)的分析方法幕庐。利用R語(yǔ)言堆疊圖，我們可以將一個(gè)項(xiàng)目中所有樣品的...

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