https://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12864-021-08286-...
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前言:這是一篇可以歸納與純生信的文章谍椅,做轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析都適用學(xué)習(xí)爹殊,基礎(chǔ)型文章譬挚。這篇文章發(fā)表期刊:MBC Genomics,屬于二區(qū)期刊刃唐。我大體看...
一.流程介紹 后續(xù)會(huì)開發(fā)lncRNA羞迷、smallRNA、circRNA流程首先是lncRNA流程唁桩,主要分析模塊為: 測序數(shù)據(jù)質(zhì)控闭树; 序列比對(duì)分析...
上次講到sRNA數(shù)據(jù)如何去接頭耸棒,那么接下來的常規(guī)操作是什么荒澡? 一、去冗余(collapse)--- 用于比對(duì)的數(shù)據(jù)是否需要去冗余 作用:將相同r...
摘要 ??測了擬南芥整個(gè)生長階段的來自27個(gè)不同組織或器官的小RNA与殃。對(duì)測序數(shù)據(jù)進(jìn)行分析之后發(fā)現(xiàn)大多數(shù)的miRNA普遍存在单山,然而有少數(shù)的miRN...
文獻(xiàn)信息 標(biāo)題:Global identification of Arabidopsis lncRNAs reveals the regulat...
[1]Szabo L, Salzman J. Detecting circular RNAs: bioinformatic and experi...
這個(gè)時(shí)候已經(jīng)不是表達(dá)矩陣的事情了碍现,要從新從fastq測序數(shù)據(jù)開始。對(duì)測序后的fastq數(shù)據(jù)進(jìn)行轉(zhuǎn)錄本的組裝米奸≈缃樱基于組裝后的轉(zhuǎn)錄本,通過數(shù)據(jù)庫注釋去...