重測序:是對已對已知基因組的物種進行測序吻氧,去挖掘不同個體和群體之間的差異性。 重測序分析內(nèi)容: SNP,INDEL, SV , SNV 進化分析...
![240](https://upload.jianshu.io/collections/images/1944766/crop1615910534418.jpg?imageMogr2/auto-orient/strip|imageView2/1/w/240/h/240)
重測序:是對已對已知基因組的物種進行測序吻氧,去挖掘不同個體和群體之間的差異性。 重測序分析內(nèi)容: SNP,INDEL, SV , SNV 進化分析...
之前R都是在Windows運行比較多,Rstudio基本滿足數(shù)據(jù)分析和繪圖需求。但是這次通過R進行WGCNA岩齿,基因數(shù)目比較多Windows帶不動...
寫在前面: 分析之前需要兩個文件文件1:countMatrix.txt數(shù)據(jù)虫碉,其中存儲著實驗組與對照組的基因表達的count值(行是基因呛哟,列是樣本...
00 寫在前面 測序后公司交付數(shù)據(jù)時叠荠,一般會提供質(zhì)控后的clean data和后續(xù)的基礎分析結果。因為可能需要自己來進行數(shù)據(jù)的預處理扫责,記得一定要...
分享一篇高質(zhì)量文章榛鼎,主要借鑒畫圖部分 這篇文章的圖是我在另外一個簡書作者文章里找到的,有興趣可以看一下 這篇文章[https://www.jia...
當位于某一座位的特定等位基因與另一座位的某一等位基因同時出現(xiàn)的概率大于群體中因隨機分布的兩個等位基因同時出現(xiàn)的概率時鳖孤,就稱這兩個座位處于連鎖不平...
高通量測序又稱NGS者娱,重新定義了基因組學研究。近年來淌铐,NGS技術穩(wěn)步發(fā)展肺然,伴隨著成本下降以及測序應用呈指數(shù)增加。本文腿准,我們研究了影響測序文庫質(zhì)量...
一际起、數(shù)據(jù)整理 1、在Excel中整理數(shù)據(jù)如下吐葱。 2街望、復制粘貼到SPSS中。 3弟跑、變量視圖灾前,調(diào)整變量名稱和小數(shù)位數(shù)。 二孟辑、單因素方差分析 三哎甲、結果...
1. BAMStats BAMStats是一款從BAM文件中計算覆蓋度和其他數(shù)據(jù),并生成這些數(shù)據(jù)的描述性統(tǒng)計的工具 1.1 安裝 1.2 使用 ...
畫圖網(wǎng)站http://gsds.gao-lab.org/[http://gsds.gao-lab.org/] 本文主要講bed文件的制作饲嗽,記錄一...