一、 寫(xiě)在前面 2023年4月中旬自己開(kāi)始做基因家族的分析厘肮，對(duì)于這塊自己沒(méi)有接觸過(guò)拷橘，因此也是一個(gè)挑戰(zhàn)，沒(méi)事Ｆ蕖５贝啊！（安慰自己）寸宵，對(duì)于基因家族的分析...
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基于TBtools做基因家族分析教程 （全） -
【ATAC-Seq 實(shí)戰(zhàn)】五崖面、peaks、motif注釋這里是佳奧梯影！新的一年巫员，ATAC-Seq的學(xué)習(xí)也進(jìn)入了尾聲。 讓我們開(kāi)始吧甲棍！ 1 peaks注釋 統(tǒng)計(jì)peak在promoter简识，exon，int...
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基因功能富集調(diào)控網(wǎng)絡(luò)分析--FGNetFGNet介紹 ??FGNet（Functional Gene Networks derived from biological enrichm...
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基因組學(xué)（課程筆記）-- 泛基因組泛基因組（Pangenome）：指的是某一物種全部基因的集合 （A Pangenome refers to a collection of ge...
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ChIP-Seq——MAnorm差異分析
一感猛、 MANorm介紹 MAnorm是一個(gè)穩(wěn)健的模型七扰，用于定量比較 TF（轉(zhuǎn)錄因子）或表觀遺傳修飾的 ChIP-Seq 數(shù)據(jù)集。MAnorm 使...
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linux版本mrbayes和iqtree跑多基因樹(shù)基本思路就是利用phylosuite軟件下載序列陪白，串聯(lián)尋找mrbayes和iqtree軟件的模型颈走，然后用多線程的mrbayes和iqtree跑樹(shù)...
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MetaPhlAn4 Meta taxonGithub: https://github.com/biobakery/MetaPhlAn/wiki/MetaPhlAn-4[https://...
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11.GWAS：確定候選區(qū)間
確定了與表型顯著的SNP位點(diǎn)后，通常會(huì)選擇在顯著性位點(diǎn)所在位置前后咱士，各一定的距離內(nèi)立由，確定候選區(qū)間轧钓，進(jìn)行候選基因挖掘，而這個(gè)距離如何確定锐膜？9.5 ...
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Multi-omics Hammer軟件之fasta格式整理和保守結(jié)構(gòu)域查找上一篇推文主要介紹了一下Multi-omics Hammer軟件的Aligment功能毕箍，本篇就接著上一篇推文繼續(xù)介紹如何使用該軟件進(jìn)行fasta...
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dotPlotly 比較兩個(gè)不同組裝的效果可視化dotPlotly[https://github.com/tpoorten/dotPlotly]工具，是利用Ｒ語(yǔ)言寫(xiě)的可視化Minimap...
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