蛋白質(zhì)組知識(shí)背景 蛋白質(zhì)組(proteome)：由一個(gè)細(xì)胞灵奖、一個(gè)組織或一個(gè)機(jī)體的基因組所表達(dá)的全部相應(yīng)的蛋白質(zhì)趾盐，是一個(gè)整體的概念。 蛋白質(zhì)組學(xué)(...
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蛋白質(zhì)組學(xué)知識(shí)背景及分析流程 -
分享：uniprot網(wǎng)站進(jìn)行各種基因秸架、蛋白ID轉(zhuǎn)換
網(wǎng)站地址：https://www.uniprot.org/[https://www.uniprot.org/] 點(diǎn)擊進(jìn)去之后你會(huì)發(fā)現(xiàn)該網(wǎng)站支持各...
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蛋白ID轉(zhuǎn)基因ID
將Ensembl 中的蛋白ID轉(zhuǎn)化成基因ID,可以通過(guò)clusterProfiler這個(gè)包。如以大鼠的基因與蛋白轉(zhuǎn)化為例;安裝clusterPr...
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定量蛋白組生信分析主要來(lái)源于諾禾公司文件學(xué)習(xí)筆記咆蒿，略有修改东抹，侵權(quán)刪蚂子！ 1）蛋白功能注釋 目前提供注釋的通用功能數(shù)據(jù)庫(kù)主要有 GO、KEGG缭黔、COG 等食茎。通過(guò)利用這...
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定量蛋白組學(xué)分析流程注意：本文完全摘抄于簡(jiǎn)書(shū)：iTRAQ定量蛋白質(zhì)組筆記(上) 僅為個(gè)人學(xué)習(xí)使用，如有侵權(quán)馏谨，請(qǐng)聯(lián)系刪除别渔，謝謝！ 前言 這篇筆記是騰訊課堂上的蛋白質(zhì)組...
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R包c(diǎn)lusterProfiler: 轉(zhuǎn)換ID惧互、GO/KEGG富集分析參考這篇ID轉(zhuǎn)換不用怕哎媚，clusterProfiler幫你忙這篇詳細(xì)講了無(wú)參考基因組該怎么辦，值得一看 簡(jiǎn)單介紹一下幾種常用的ID：Ensemb...
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clusterProfiler包進(jìn)行id轉(zhuǎn)換常用id Ensemble id：由歐洲生物信息數(shù)據(jù)庫(kù)提供喊儡，一般以ENSG開(kāi)頭拨与，后邊跟11位數(shù)字。如TP53基因：ENSG00000141510...
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