首先附上軟件鏈接：https://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/systemP...

現(xiàn)在ChIP-seq的數(shù)據(jù)基本是最常見的測(cè)序數(shù)據(jù)類型之一潜叛，主要有Transcription factor ChIP-seq和Histone Ch...

SAMBAMBA http://lomereiter.github.io/sambamba/ 一贩据、安裝 (支持mac OS/linux 64位)...

開篇致謝：下面內(nèi)容的整個(gè)框架是跟著生信技能樹發(fā)布在bilibili上的ChIP-seq視頻學(xué)習(xí)的枣抱，鏈接：https://www.bilibili...

之前寫過ChIP-seq的基礎(chǔ)分析：ChIP-seq數(shù)據(jù)分析（一）：從raw reads到peaks，和此文有很多相似之處。 簡(jiǎn)介 ATAC-s...

學(xué)習(xí)目標(biāo)： 學(xué)會(huì)用MACS2 call peaks 理解MACS2 call peaks的結(jié)果 Peak Calling Peak callin...

今天介紹和測(cè)試這款關(guān)聯(lián)ChIP-seq、RNA-seq分析軟件执桌，BETA（Binding and Expression Target Analy...

背景： 染色質(zhì)和染色體的結(jié)構(gòu)和功能 每一條染色單體由單個(gè)線性DNA分子組成。細(xì)胞核中的DNA是經(jīng)過高度有序的包裝厦凤，否則就是一團(tuán)亂麻鼻吮，不利于DNA...

參考生信技能樹1以及生信技能樹2只記錄從數(shù)據(jù)下載育苟，到最終結(jié)果展示较鼓，具體生物學(xué)知識(shí)請(qǐng)自行查閱稍后關(guān)于ChIP-seq的背景知識(shí)我會(huì)再發(fā)布一篇文章。...

放在最前面的參考鏈接：給學(xué)徒的ATAC-seq數(shù)據(jù)實(shí)戰(zhàn)（附上收費(fèi)視頻) 數(shù)據(jù)來源的文章： The landscape of accessible...