概覽 Title：From GWAS to Function: Using Functional Genomics to Identify th...
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post-GWAS era文章分享3-From GWAS to Function: Using Functional Genomics to Identify the Mechanisms Un... -
三維基因組組織結(jié)構(gòu)在免疫細(xì)胞命運(yùn)分化和功能中的作用（下篇）摘要 免疫細(xì)胞的分化荚孵、發(fā)育和激活需要轉(zhuǎn)錄程序的精確和協(xié)調(diào)控制臂外∽鲁Γ基因組的三維（3D）組織結(jié)構(gòu)已成為染色質(zhì)狀態(tài)尤辱、轉(zhuǎn)錄活性和細(xì)胞身份決定的重要調(diào)節(jié)因子...
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三維基因組組織結(jié)構(gòu)在免疫細(xì)胞命運(yùn)分化和功能中的作用（上篇）摘要 免疫細(xì)胞的分化纷妆、發(fā)育和激活需要轉(zhuǎn)錄程序的精確和協(xié)調(diào)控制毁腿±蚋疲基因組的三維（3D）組織結(jié)構(gòu)已成為染色質(zhì)狀態(tài)、轉(zhuǎn)錄活性和細(xì)胞身份決定的重要調(diào)節(jié)因子...
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干貨进萄！Hi-C研究抽象變具象捻脖，就讀這篇！2009年中鼠，Job Dekker首次開發(fā)出Hi-C技術(shù)可婶，實(shí)現(xiàn)了全基因組單位內(nèi)染色體片段間相互作用的捕獲。高通量染色體三維構(gòu)象捕獲技術(shù)Hi-C（H...
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3D百文6-TAD識(shí)別計(jì)算方法的比較Comparison of computational methods for the identification of topologica...
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Chicdiff使用Capture Hi-C 是一種檢測至少在一端涉及感興趣的 DNA 區(qū)域援雇，如基因啟動(dòng)子染色體相互作用的有效方法矛渴。 Chicdiff，是一個(gè)用于捕...
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HI-C數(shù)據(jù)分析 pipeline（二：數(shù)據(jù)格式轉(zhuǎn)換）
由于HIC數(shù)據(jù)目前很難用一個(gè)軟件就能將全套流程全部分析完惫搏，從數(shù)據(jù)預(yù)處理到后續(xù)的TAD計(jì)算具温，loop計(jì)算等需要用到眾多軟件，但是在數(shù)據(jù)格式方面筐赔，各...
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HI-C數(shù)據(jù)分析 pipeline（一：上游數(shù)據(jù)預(yù)處理）
Hi-C fastq data to valid pair and matrix data format transition.本文總結(jié)了Hi-...
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HiCExplorer使用
HiCExplorer[https://hicexplorer.readthedocs.io/en/latest/index.html] 1铣猩、數(shù)...
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3D百文--3D基因組中的TAD是否是跨物種保守的？沒想到所謂的TAD跨物種保守的證據(jù)是如此不足的茴丰，感覺有點(diǎn)拍腦袋和人云亦云的意思 不過后面還有幾篇新的幾篇文章針對這篇文章提出的問題做了點(diǎn)工作 A...
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