基因家族和關(guān)聯(lián)分析 - 專(zhuān)題

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Fine mapping定位QTL
作物遺傳育種需要發(fā)掘?qū)r(nóng)藝性狀有重要貢獻(xiàn)的QTL躏哩。某一重要農(nóng)藝性狀往往是由多個(gè)QTL調(diào)控腕扶。對(duì)這些QTL進(jìn)行精細(xì)定位找出對(duì)應(yīng)的基因?qū)ψ魑锏母?..

2.3 陳牛牛 0 29
R語(yǔ)言手動(dòng)計(jì)算Tajima's D 和 Fst
原理和公式參考： http://www.reibang.com/p/c7ba1aa543fe[http://www.reibang.com/...

0.9 楊康chin 0 9

2021.11.19 | 群體遺傳結(jié)構(gòu)、PCA有额、進(jìn)化樹(shù)
常見(jiàn)的群體結(jié)構(gòu)的分析方法有admixture分析、系統(tǒng)發(fā)生數(shù)分析以及主成分分析等黑忱。 1烟具、admixture分析 1）R語(yǔ)言繪圖 admixtur...

1.2 千萬(wàn)別加香菜 3 16
全基因組選擇的工具（轉(zhuǎn)載）
本文轉(zhuǎn)載自：Bionifarmer[https://www.cnblogs.com/jessepeng/p/14395909.html]。個(gè)人感...

0.8 Hello育種 0 15
6. GWAS：主成分分析——GCTA
利用協(xié)方差矩陣布轿，特征值和特征向量將高緯變量投影到數(shù)個(gè)低維變量的過(guò)程哮笆； PCA分析的過(guò)程就是從千萬(wàn)級(jí)別的SNP位點(diǎn)中提取關(guān)鍵信息来颤，以便使用更少的變...

1.2 Wei_Sun 11 29
雜合度
1 使用plink挑選個(gè)體注意bsz.txt是要提取的樣本名，為兩列稠肘。

0.1 鈴_0d92 0 1
PLINK+TASSEL做GWAS+Post-GWAS分析
此視頻來(lái)自B站福铅，是非常好和全的的一個(gè)GWAS操作的視頻，從開(kāi)始準(zhǔn)備軟件下載项阴，數(shù)據(jù)過(guò)濾本讥，到最后的候選基因注釋。GWAS的實(shí)戰(zhàn)視頻https://w...

1.9 Hello育種 6 34

全基因組選擇的模型匯總（轉(zhuǎn)載）
本文轉(zhuǎn)載自：Bionifarmer[https://www.cnblogs.com/jessepeng/p/14375487.html]鲁冯。個(gè)人感...

1.7 Hello育種 0 27
幾種繪制基因組共線圖的方法
1.MCscanMCscan繪制共線圖MCscan需要準(zhǔn)備cds.fasta和.gff注釋文件cds.fasta文件可以從基因組序列中提取配置...

0.4 追夢(mèng)生信人 0 7
缺失基因型填充
作者：陳美佳一拷沸、問(wèn)題描述基因型數(shù)據(jù)的缺失分為遺傳性缺失和檢測(cè)性缺失： 1、遺傳性缺失：個(gè)體遺傳信息的變異（例如薯演，這個(gè)位點(diǎn)DNA片段真實(shí)缺失）...

0.6 蝦里巴人 0 13