12篇文章 · 9222字 · 3人關注
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融合基因和可變剪接融合基因 融合基因的分析也是轉錄組下游的一個分析硼一，通常發(fā)生在染色體重排的情況下，導致距離相隔較遠的的基因結合在一起揪胃，這種組合會造成基因失調和生成...
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DNA甲基化DNA甲基化是表觀遺傳學研究中的一個重要一個分支，符合表觀遺傳學DNA的序列信息沒有改變的特地點，而是DNA的堿基發(fā)生了化學修飾枯跑。最常見的一種修...
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無參轉錄組序列組裝 — Trinity轉錄組分析策略 轉錄組分析策略根據有無參考轉錄組可以分為兩類： 有參比對—定量—差異分析—功能富集分析等 無參組裝—定量—差異分析—功能富集分析...
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用「SAR」實時監(jiān)控記錄CPU，memory和I/O在做一些軟硬件測評的工作白热，需要記錄并統(tǒng)計每個流程中每一步所耗資源敛助，如CPU, 內存和I/O。在某個公司分享的方法中屋确，看到他們用「SAR」這個命令...
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計算位點的覆蓋度和深度前面搜集了一些計算測序覆蓋度和深度的方法辜腺，這次詳細介紹下samtools如何解決了我的問題。 計算WGS/WES/panel捕獲效率/覆蓋度的方...
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計算WGS/WES/panel捕獲效率/覆蓋度的方法有哪些
WGS, WES, or targeted sequencing數(shù)據分析的時候乍恐，經常需要計算全基因組整體的平均測序深度或者 target 區(qū)域的...
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關于sentieon的幾點補充說明sentieon的特點 sentieon是一款商業(yè)版call變異的軟件评疗。call變異的軟件很多，為什么sentieon能商業(yè)化（據說價格還很貴）...
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MACS2文檔學習文檔鏈接：https://github.com/taoliu/MACS/MACS2是ChIP-Seq茵烈、ATAC-Seq百匆、DNAsel-Seq等分...
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Trim Galore ——自動檢測adapter的質控軟件之前分析過的測序數(shù)據，數(shù)據質量都很好呜投，給了我一個錯覺質控的前后差別不是很大加匈，內心里對質控這一步也就不是很重視，跑完質控有時也懶得看結果仑荐，拿到一批...
