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我的ChIP-Seq(5): peaks注釋
注釋一般有以下幾種方法，但是一般經驗有： 1.比對時下載UCSC格式的參考基因組锦募，后續(xù)操作障礙少2.數據準備要嚴格按照軟件的說明摆屯，若遇到格式正確...
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我的ChIP-Seq(4):MAnorm差異分析哈哈，搜了一圈沒發(fā)現網上有關于MAnorm的中文教程或者是說明糠亩，本文將是第一篇~撒花??ヽ(°▽°)ノ?那就要用心寫了虐骑，感到鴨梨.jpg== 首...
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我的ChIP-Seq(3):比對和call peaks比對（1）使用bowtie2建立index 建立index是一勞永逸的事情，還有更簡單的方法是從bowtie2的官網直接下載赎线。這一步很簡單廷没，用的...
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我的ChIP-Seq(2): cutadapt/fastp/Trimmomatic 過濾軟件選擇過濾軟件的比較與選擇：cutadapt/fastp/trimmomatic 注：還沒有完全搞明白，先總結一下特點和使用垂寥，之后再慢慢體會颠黎、總結經驗...
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我的ChIP-Seq(1): FastQC報告解讀新手，剛做完一個ChIP-Seq項目的分析滞项，來記錄一下狭归，會分好幾篇。 首先是下機數據fastqc之后會生成一個html格式的報告文判，根據報告可以看...
