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vcftools安裝
Build from Release Tarball 訪問GitHub , release中尋找最新版本（https://github.com/...
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FASTA文件統(tǒng)計序列長度
seqkit 安裝 使用 結(jié)果展示
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dotPlotly
1.目的 使用 dotPlotly 可視化 minimap2 或者 mummer 得到的序列比對結(jié)果屋群。 2.安裝 dotPlotly 其實就是個...
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fasta文件根據(jù)ID提取序列
把要提取的 序列 ID 寫入 id.txt 公浪， 一行一個ID 1.seqkit 2.seqtk
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統(tǒng)計每條序列的長度
1.bioawk 輸出結(jié)果示例： 2.seqkit 輸出結(jié)果示例：
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PacBio測序的Bam文件轉(zhuǎn)fasta文件
需求： PacBio ccs測序下機數(shù)據(jù)是bam格式的垃你。而組裝軟件一般都需要fasta格式俱两，因此需要將源文件轉(zhuǎn)換成fasta格式赎线。 軟件： SM...
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NCBI數(shù)據(jù)下載——SRAToolkit配置&下載SRR數(shù)據(jù)1.下載SRAToolkit 略 2. 配置 出現(xiàn)交互式界面舞骆，更改數(shù)據(jù)下載路徑 這個界面是可以用鼠標點擊的钥弯！保存，退出督禽。 3.下載SRR數(shù)據(jù) 腳...
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perl 模塊安裝與使用
查看perl 版本 查看perl模塊搜索路徑 查看某個perl模塊是否存在 模塊安裝方法1 —— 命令行形式安裝Set::IntervalTre...
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quast
quast 安裝 gridss 和 silva 下載好了脆霎，busco出現(xiàn)了問題”繁梗看樣子需要手動安裝busco庫睛蛛。 去busco官網(wǎng)下載了最新的版...
