往年寒暑假都是以在家寫文章度過膜楷，今年在校時候完成了旭咽，所以就把讀書提上了日程。對于讀書赌厅，我以前是不愿去做的穷绵，畢竟實(shí)驗(yàn)和文獻(xiàn)已經(jīng)消耗了大量精力。很多人讀完文獻(xiàn)可能都曾感慨：別人怎么想到的特愿，這方法也不難啊仲墨，我怎么想不到！而想不到的原因還是知識薄弱和不懂運(yùn)用揍障，于是我開始去讀一些專業(yè)書籍來幫我融會貫通目养。下面我以剛讀完的由樊龍江老師主編的《植物基因組學(xué)》為例聊聊。這里我不會談到書本知識毒嫡，建議看原書癌蚁。
該書分為兩大篇——總論（書本常見的排布方式）和各論（擬南芥、水稻、玉米匈勋、小麥、大豆膳叨、棉花洽洁、油菜等單設(shè)章節(jié)）。在總論部分菲嘴，最直接的收獲就是學(xué)到了新的術(shù)語饿自，明確了一些術(shù)語的準(zhǔn)確釋義（百度查不到、文獻(xiàn)不會寫）龄坪，解決了許多遺留問題昭雌。更重要的是書相比文獻(xiàn)更全面、易懂健田，讀完會形成一個框架烛卧，使思維發(fā)散，了解哪些更值得做妓局。在各論总放，能進(jìn)一步認(rèn)識研究相關(guān)的植物。當(dāng)然好爬，你不能指望讀完就會基因組分析了局雄，每個章節(jié)并不算詳細(xì)，更沒有實(shí)戰(zhàn)存炮，框架想填滿還得日積月累炬搭。
其實(shí)，說來說去都是廢話文學(xué)穆桂，只是想讓大家意識到開卷有益宫盔，趁著還有精力趕緊讀上幾本，獲益匪淺享完。另外飘言，我讀組學(xué)相關(guān)的書也是為了打破生物信息學(xué)習(xí)的局限。有不少人問過我怎么學(xué)生信驼侠，我認(rèn)為首先得搞清楚自己的定位姿鸿，你是能看懂生信的圖片就好（很容易實(shí)現(xiàn)），還是想完成發(fā)表級的數(shù)據(jù)分析（大部分人的目標(biāo)）倒源，更甚是開發(fā)軟件算法苛预？比如我對自身的定位就是解決生物問題，不會追求強(qiáng)大的編程能力笋熬。精力十分有限热某，得考慮清楚如何分配時間才能最大化效益。
新人入門第一步，補(bǔ)基礎(chǔ)——Linux常用命令和至少一門計(jì)算機(jī)語言昔馋。建議選擇R筹吐，見效快，有了出圖的成就感不容易棄坑秘遏。然后丘薛，我建議有目的的學(xué)，比如課題以后要用到的分析邦危，這樣才有動力洋侨。如果真沒目的，那就挑篇自己感興趣的文章倦蚪，用它公開的原始數(shù)據(jù)和代碼復(fù)現(xiàn)圖片吧希坚。以單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組為例，前幾天得先了解下發(fā)展史陵且、主流建庫測序技術(shù)原理裁僧、該組學(xué)的特殊優(yōu)勢和能解決哪些問題。之后慕购，找?guī)灼罄袀儼l(fā)布的教程慢慢推進(jìn)锅知，像生信技能樹、單細(xì)胞天地脓钾、各大生物公司的公眾號就是不錯的首選售睹。這個過程需要反復(fù)搜索術(shù)語和命令的含義并理解，判斷分析結(jié)果是否可靠并解讀可训，冒進(jìn)和丟給生信交流群是沒用的昌妹。走完流程后，應(yīng)該已經(jīng)能初步使用分析所需的軟件了握截，建議再閱讀它們的官方英文教程飞崖。因?yàn)榧夹g(shù)貼只寫通用流程，你需要針對材料優(yōu)化參數(shù)谨胞，比如動植物很多時候是有差別的固歪，能直接照搬以人為例的教程嗎。
不得不談的一點(diǎn)是胯努，為什么不建議直接死扣相關(guān)文獻(xiàn)牢裳，因?yàn)閯偨佑|不可能讀透。這也是實(shí)驗(yàn)室主要矛盾之一：老板給你一篇文獻(xiàn)并認(rèn)為你兩三天能讀透叶沛，你從未接觸過該領(lǐng)域蒲讯，因?yàn)楸焕习錺ush而急于求成，專注文獻(xiàn)好幾周甚至逐字翻譯也沒懂灰署，然后老板覺得你很廢柴判帮，你又覺得自己很無辜局嘁。一個不會引導(dǎo)，一個不會學(xué)習(xí)晦墙，鈍角（梗）悦昵！只有在基礎(chǔ)扎實(shí)的情況下讀，才能把別人的思路用到自己的課題晌畅，取長補(bǔ)短但指。至于寫文章，第一篇可以采取模仿相似論文的一般內(nèi)容踩麦、挖掘自己課題的特別內(nèi)容的策略枚赡。在解讀結(jié)果時想到什么隨時記錄氓癌，即使想錯了谓谦，尤其注意奇怪的點(diǎn)，可能寫出來就是亮點(diǎn)贪婉。
想要有長足的發(fā)展反粥，就得注意日常積累了，讓知識轉(zhuǎn)變?yōu)槌ＷR——生物學(xué)常識疲迂、統(tǒng)計(jì)學(xué)常識和計(jì)算機(jī)常識才顿。如果你真要走上開發(fā)軟件算法的道路，得先接受文章發(fā)表后無人問津的可能尤蒿，不得不承認(rèn)郑气，我們常用的軟件算法僅出于幾人之手。
言盡于此腰池，僅供參考尾组，希望大家都能找到適合自己的學(xué)習(xí)方式。祝新年快樂示弓，科研順利讳侨！
