群體結(jié)構(gòu)分析
在一個大群體中伏穆，不同的個體之間群體結(jié)構(gòu)是存在差異的蕉汪，換句話說就是不同個體的遺傳物質(zhì)來自不同的祖先。
一種顏色代表一種群體結(jié)構(gòu)黍析，來自同一個祖先节沦。
其中有些個體包含了不同祖先的遺傳物質(zhì)键思。
是雜交或者基因交流造成。
系統(tǒng)發(fā)生樹分析
通過Mega或phylip等進(jìn)化樹分析軟件甫贯，基因單體型多態(tài)性snp進(jìn)行聚類分析吼鳞，得到系統(tǒng)發(fā)生樹。相同地域叫搁，相同亞種或者相同表型的樣品更容易聚到一起赔桌，可以解釋物種起源進(jìn)化等問題。
全基因組關(guān)聯(lián)分析
- 概念
以長期重組后保留下來的基因（位點(diǎn)）間連鎖不平衡（LD）為基礎(chǔ)常熙，在獲得群體表型數(shù)據(jù)與基因型數(shù)據(jù)后纬乍，采用統(tǒng)計(jì)方法檢測遺傳多態(tài)性與性狀可遺傳變異之間的關(guān)聯(lián)，目標(biāo)即是找尋可能引發(fā)性狀變異的基因組功能型變異（基因位點(diǎn)或標(biāo)記位點(diǎn)）裸卫。 - 優(yōu)點(diǎn)：
1.不需要構(gòu)建特殊的群體
2.可同時對多個性狀進(jìn)行分析
3.自然群體經(jīng)歷了許多輪重組后仿贬，LD衰減，存在于很短的距離內(nèi)墓贿，保證了定位的更高精確性
研究單體型的意義
單體型并不能完全直接確定與疾病相關(guān)的基因茧泪，而是通過確定單體型蜓氨，使單體型圖成為用于進(jìn)行關(guān)聯(lián)研究的一個工具。
在關(guān)聯(lián)研究中队伟，研究人員將患者(性狀A(yù))的單體型與健康人（對照性狀B）的單體型相比較穴吹。如果與對照相比，某一種單體型在患者中經(jīng)常出現(xiàn)嗜侮，影響該疾病的基因可能就存在于這個單體型內(nèi)部或附近港令。
通過連鎖區(qū)域的確定，從而確定世世代代的遺傳病相關(guān)區(qū)域或者基因锈颗。
把僅僅能單個SNP位點(diǎn)的關(guān)聯(lián)分析顷霹，擴(kuò)大到一個區(qū)域，從而縮小了分析目標(biāo)—分析工作量大大減少击吱。
能夠找到多位點(diǎn)遺傳的相關(guān)性狀等淋淀。
能夠給遺傳進(jìn)化提供一定的理論依據(jù)。
