KEGG and GO
蛋白網(wǎng)站
UniProt (強大的蛋白結(jié)構(gòu)和功能注釋網(wǎng)站)
HPA(可查看蛋白表達以及亞細胞定位)
String (PPI)
BioGRID(相互作用蛋白的PPI網(wǎng)絡(luò)圖)
TCPA與TCGA相對應(yīng)可免,用于訪問可視化腫瘤蛋白組學(xué)網(wǎng)站
PDB蛋白結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫
SWISSMODEL蛋白3D結(jié)構(gòu)預(yù)測
Pfam蛋白結(jié)構(gòu)及功能預(yù)測
基因及蛋白分析網(wǎng)站
GEPIA可進行基因表達劫恒、共表達裕偿、預(yù)后等分析
TIMER可進行基因表達汪疮、共表達叮喳、預(yù)后购啄、免疫等分析
Cbioportal數(shù)據(jù)庫之神可進行突變睁宰、突變結(jié)構(gòu)肪获、共表達富集等分析 網(wǎng)站使用說明
Linkedomics可分析基因在不同腫瘤的表達以及相關(guān)基因的表達
BioGRID可以查詢基因、蛋白柒傻、藥物孝赫、PPI、關(guān)聯(lián)基因诅愚、GO等可以關(guān)聯(lián)到好多其他網(wǎng)站寒锚,功能強大!
UALCAN相關(guān)基因以及預(yù)后
Depmap腫瘤細胞系违孝、基因刹前、藥物
TISIDB查詢基因、基因富集(GO KEGG)雌桑、免疫等信息
TCPA與TCGA相對應(yīng)喇喉,用于訪問可視化腫瘤蛋白組學(xué)網(wǎng)站,關(guān)聯(lián)基因,生存分析
CTD藥物基因疾病相互作用分析
chilibot可繪制基因表型互作圖
查詢基因信息
genecards查詢基因詳細信息 - 非常強大校坑,會直接連接到HGNC/HUGO,NCBI,ensembl,OMIM,UniProt 網(wǎng)站
Genome Browser Gateway還可查詢基因啟動子序列
DISEASE查詢基因與疾病
BioGPS查詢基因詳細信息以及基因在細胞和組織中的表達量
EMBL-EBI可查詢基因蛋白化合物信息
ensembl基因瀏覽器+gene ID轉(zhuǎn)換
TISIDB查詢基因拣技、基因富集(GO KEGG)、免疫等信息
HGNC/HUGO可查詢基因信息
COSMIC可查詢基因突變信息
OMIM包括文本信息和相關(guān)參考信息邪驮、序列紀錄莫辨、圖譜和相關(guān)其他數(shù)據(jù)庫。
細胞系信息網(wǎng)站
分析關(guān)聯(lián)基因:
生存分析
PrognoScan 可分析特殊GEO數(shù)據(jù)集預(yù)后
TCPA與TCGA相對應(yīng),用于訪問可視化腫瘤蛋白組學(xué)網(wǎng)站,關(guān)聯(lián)基因守呜,生存分析
藥物分析
GDSC藥物細胞系敏感性分析網(wǎng)站
Depmap腫瘤細胞系型酥、基因山憨、藥物
BioGRID可以查詢基因、蛋白冕末、藥物萍歉、PPI、關(guān)聯(lián)基因档桃、GO等可以關(guān)聯(lián)到好多其他網(wǎng)站枪孩,功能強大!
CTD藥物基因疾病相互作用分析
Drugbank藥物查詢網(wǎng)站
EMBL-EBI可查詢基因蛋白化合物信息
免疫分析
特殊數(shù)據(jù)庫
eFORGE 表觀遺傳數(shù)據(jù)庫
CellMarker 細胞標志物數(shù)據(jù)庫,可用于單細胞測序
COSMIC癌癥體細胞突變數(shù)據(jù)庫
通路可視化數(shù)據(jù)庫
Selleckchem : https://www.selleck.cn/ 抑制劑
CRISPRlnc : http://www.crisprlnc.org/ crispr/lncRNA
MRPrimerW2 : http://mrprimerw2.com/ qPCR引物
ChIPprimersDB : https://www.chipprimers.com ChIP-PCR引物
PrimerBank:https://pga.mgh.harvard.edu/primerbank/ qPCR引物
Addgene:http://www.addgene.org/ 載體信息共享網(wǎng)站
2.實驗protocol數(shù)據(jù)庫 Jove : https://www.jove.com 視頻/權(quán)限
bio-protocol : https://bio-protocol.org/cn/default.aspx protocol
Current Protocols : https://currentprotocols.onlinelibrary.wiley.com/ protocol
Nature protocol : https://www.nature.com/nprot/ protocol
Springer Protocols : https://experiments.springernature.com/springer-protocols-closure protocol
Cold Spring Harbor Protocols : http://cshprotocols.cshlp.org/ protocol