PD-1（程序性死亡分子1），有PDCD1基因編碼送膳，是一種重要的免疫抑制分子瘦癌。之前我們對HPA數據庫進行的簡介艾帐，這里我們將利用HPA數據庫示例，搜索血液中不同免疫細胞PD1基因表達情況盆偿。
進入HPA數據庫柒爸，搜索檢索詞：PDCD1，在結果檢索界面選擇“Blood”事扭。在該界面上捎稚，我們可以看到PDCD1的一般信息，以及人類蛋白表達圖譜信息求橄。我們發(fā)現PDCD1預測的部分主要為細胞內和細胞膜今野，在蛋白譜里可以看到該基因在哪個細胞系上富集。
繼續(xù)下拉罐农，我們可以看到在三個數據庫中相關信息条霜，分別是Consenses?dataset，Monaco scaled dataset和Schmiedel dataset涵亏。我們可以看到Consenses?dataset中描述了PDCD1在19種細胞中表達情況宰睡，Monaco scaled dataset分類更細致，有30種气筋，其中免疫細胞分了更過的亞群拆内，最后在Schmiedel dataset中，只描述了在血液免疫細胞中表達情況裆悄。
Consenses?dataset：PDCD1主要在T細胞上表達矛纹，表達最高的是記憶CD8T細胞，其次記憶CD4T細胞光稼，在GdT ,調節(jié)T或南，MAIT?T也有一定程度表達，在Naive CD4和Navie CD8?表達很低艾君，其余細胞幾乎不表達采够。
Monaco scaled dataset：同樣顯示PDCD1主要集中在T細胞上，其中Effector記憶CD8T表達最高冰垄，具體我們可以通過點擊Expression去看表達順序蹬癌。
Schmiedel dataset：顯示PDCD1在T細胞表達比較高，但是區(qū)別前面兩個數據庫結果虹茶，這里表達最高的是記憶CD4T逝薪，因為我們發(fā)現細胞類別中沒有記憶CD8T，因此我們了解到不同數據庫選擇細胞類型是有區(qū)分蝴罪，我們根據我們具體需求選擇相應數據董济。
另外我們可以通過圖譜右上側的Lineage,Expression和Alphabetical選擇排序方式。
今天示例就簡單介紹這里了要门，下次再見虏肾。
