DNA序列和甲基化數(shù)據(jù)分析

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本文作者:任紅雷,聯(lián)系郵件:renhongleiz@126.com

本文主要分為兩部分:即生物信息學(xué)背景簡介以及甲基化數(shù)據(jù)處理,摘取自本人匯報(bào)的PPT鼎姊。

目錄

目錄

1.測序技術(shù)

測序技術(shù)

1.1 Sanger測序(一代測序)

Sanger測序原理1-雙脫氧鏈終止法
Sanger測序原理2
Sanger測序結(jié)果

1.2 NGS測序(第二代測序)

NGS測序(第二代測序)_邊合成邊測序
NGS測序(第二代測序)_邊合成邊測序

1.3 單分子測序

單分子測序

1.4 計(jì)算技術(shù)發(fā)展

計(jì)算技術(shù)發(fā)展
摩爾定律

1.5 生物信息學(xué)發(fā)展

人類基因組計(jì)劃
人類基因組計(jì)劃1995年進(jìn)度
人類基因組計(jì)劃2001年初步完成
生物信息學(xué)開創(chuàng)人
生物信息學(xué)早期工作

1.6 DNA甲基化數(shù)據(jù)處理流程

1.6.1 目標(biāo)

DNA甲基化數(shù)據(jù)處理流程與任務(wù)目標(biāo)

1.6.2 數(shù)據(jù)資源

數(shù)據(jù)資源
數(shù)據(jù)資源
數(shù)據(jù)資源

1.6.3 數(shù)據(jù)格式

數(shù)據(jù)格式
數(shù)據(jù)格式
數(shù)據(jù)格式
數(shù)據(jù)格式

1.6.4 編程工具

編程工具
編程工具
程序流程
R拓展包
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