2022-11-04 samtools sort: truncated file. Aborting

從文章里下的RNA-seq的數(shù)據(jù)分析，在做到sam轉(zhuǎn)bam這一步時候報錯，我先用的代碼是
samtools sort -O BAM -o d2_r1.sort.bam -@ 6 d2_r1.sam
然后報錯：

samtools sort: truncated file. Aborting

查了資料發(fā)現(xiàn)似乎是nohup在作怪
所以重新回到生成sam文件的那一步，這次不用nohup代乃，然后再去做轉(zhuǎn)bam文件
成功了

處理另一個文件的時候又出現(xiàn)了這個錯誤

samtools sort hPGCLC_d2_r2.sam > hPGCLC_d2_r2.bam

最后編輯于：2022.11.05 12:43:51

?著作權(quán)歸作者所有,轉(zhuǎn)載或內(nèi)容合作請聯(lián)系作者

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