在做monocle3的最后需要在圖中顯示軌跡漆改,會(huì)用到plot_cells這個(gè)函數(shù)线椰,如 plot_cells(cds, label_groups_...
從文章中下載的數(shù)據(jù)往往是一個(gè)表達(dá)矩陣和metadata.txt躏啰,如何使用這兩個(gè)數(shù)據(jù)呢劲绪? 讀入表達(dá)矩陣,創(chuàng)建seurat對(duì)象nature<-rea...
1.在Python上用scanpy分析單細(xì)胞的時(shí)候副女,做到sc.pp.calculate_qc_metrics(adata, qc_vars=['...
在seurat分析單細(xì)胞數(shù)據(jù)的時(shí)候妥曲,用了PercentageFeatureSet這個(gè)函數(shù),報(bào)錯(cuò)了: Error in h(simpleError...
從文章里下的RNA-seq的數(shù)據(jù)分析古毛,在做到sam轉(zhuǎn)bam這一步時(shí)候報(bào)錯(cuò)翻翩,我先用的代碼是samtools sort -O BAM -o d2_r...
服務(wù)器版本:Centos7.8 1.root權(quán)限創(chuàng)建一個(gè)叫shiny的用戶useradd shinypasswd shiny2.賦予shiny用...
解決方法conda install -c conda-forge imagemagick再重新運(yùn)行install.packages("ggima...
這篇文章主要介紹做RNA Velocity需要怎么做,至于原理請(qǐng)參考原文章 在做RNA速率之前需要先準(zhǔn)備loom文件稻薇,換句話說(shuō)就是要完成RNA速...
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