基本90%以上純生信數(shù)據(jù)挖掘類文章都離不開這兩個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)球凰,第一個(gè)就是GEO數(shù)據(jù)庫(kù)死相,第二個(gè)就是TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)忿项,這兩個(gè)都是免費(fèi)的公共數(shù)據(jù)庫(kù)哼转,用戶可以免費(fèi)進(jìn)行下載數(shù)據(jù)分析整理并且發(fā)表相關(guān)文章窃这。我們下載相關(guān)數(shù)據(jù)選擇的物種基本上是human(GEO還有其他物種瞳别,TCGA的全部都是臨床病人數(shù)據(jù)),研究涉及臨床病人的話杭攻,期刊編輯往往讓你提交倫理委員會(huì)批準(zhǔn)證明文件祟敛,有些期刊編輯懂這些數(shù)據(jù)挖掘的話就不做要求,如果不懂的話朴上,往往都是將論文打道回府垒棋,提交倫理委員會(huì)批準(zhǔn)證明文件。
為了減少上面的麻煩痪宰,我們?cè)谡撐闹锌梢栽黾右韵逻@幾句話:
Acknowledgments
We acknowledge TCGA and GEO database for providing their platforms and contributors for uploading their meaningful datasets.?
(如果沒有基金掛的話叼架,很多人都會(huì)寫上None,在致謝部分其實(shí)我們可以感謝一下TCGA衣撬、GEO數(shù)據(jù)庫(kù)乖订,因?yàn)闆]有這些數(shù)據(jù)庫(kù),估計(jì)有很多人沒有辦法畢業(yè)或者評(píng)職稱具练,不管怎么樣乍构,我們都是要感謝一下的。)
Disclosure
TCGA and GEO belong to public databases. The patients involved in the database have obtained ethical approval. Users can download relevant data for free for research and publish relevant articles. Our study?is based on open source data, so there are no ethical issues and other conflicts of interest.
這里說的是純生信數(shù)據(jù)挖掘類文章扛点,如果是生信分析+臨床樣本驗(yàn)證類文章哥遮,是需要你提供相關(guān)倫理獲批證明文件的,因?yàn)槟闶占讼嚓P(guān)病人樣本陵究,涉及到了人眠饮,理應(yīng)當(dāng)要經(jīng)過倫理委員批準(zhǔn)后才能開展相關(guān)工作。有些人往往不重視倫理問題铜邮,拿到樣本就去做研究了仪召。這樣做后果很嚴(yán)重,即使文章發(fā)表了也是沒有用的松蒜,小的話就是文章被撤稿扔茅,大的可能整個(gè)課題組都被該期刊拉黑,特別是業(yè)內(nèi)的權(quán)威期刊秸苗。