這里是佳奧盯拱！
這里記錄一些我使用GSAman 的心得弥喉。
1郁竟、.gsaman文件
選擇一個(gè).gff3文件，直接修改文件后綴為.gff3.gsaman
把修改后綴的文件拖入即可由境，會(huì)創(chuàng)建索引文件
2棚亩、選擇.gsaman的注釋片段
右鍵 Copy CDS查看是否ATG開(kāi)頭，TAG結(jié)尾
右鍵 Copy mRNA序列虏杰，進(jìn)TBtools讥蟆，ORF Prediction——Complete/Partial ORF Predict (Single Mode)，預(yù)測(cè)開(kāi)放閱讀框
3纺阔、注釋預(yù)測(cè) Softberry
http://www.softberry.com/
http://www.softberry.com/berry.phtml?topic=fgenesh&group=programs&subgroup=gfind
右鍵 Softberry Predict
進(jìn)入網(wǎng)站復(fù)制序列瘸彤，選擇物種，全選結(jié)果復(fù)制到彈出窗口
4笛钝、切除/添加外顯子
發(fā)現(xiàn)一段基因中間有內(nèi)含子：右鍵 SLICE this exon质况，然后鼠標(biāo)左右拖動(dòng)
添加外顯子：右鍵 ADD/INSERT an exon
5、導(dǎo)出.gsaman到.gff3
右鍵玻靡，EXPORT to gff3 File
