1矗积、安裝R
先安裝R語言，到官網(wǎng)https://www.r-project.org/够庙，點擊download R靠娱，選擇鏡像China的隨便一個，選擇download R for Windows敛纲，選擇install R for the first time 喂击， 選擇最新版本，一般就是第一行淤翔，Download R 4.0.4 for Windows翰绊，下面也有pervious release舊版本，下載舊版本版本一般只需要選擇R-版本號-win.exe下載即可旁壮。然后安裝监嗜，選擇組件的一步全選，路徑自己改抡谐，其他默認(rèn)安裝完成裁奇。
2、安裝R Studio
在安裝R Studio麦撵，到官網(wǎng)https://rstudio.com/下載刽肠，點擊Download it now溃肪，選擇Windows ，Rstudio Desktop音五，free的那個惫撰，最新版本，一般也是最上面的那個installer躺涝。然后默認(rèn)安裝厨钻，自己改路徑。
3坚嗜、安裝clusterprofiler R包
clusterprofiler是用來做GO和kegg富集分析的莉撇，本來下來是為了bitr（）這個命令可以轉(zhuǎn)化id，但是因為我是水稻惶傻，水稻注釋信息的R包(http://bioconductor.org/packages/release/data/annotation/html/BSgenome.Osativa.MSU.MSU7.html)不知道為啥安裝總是參數(shù)出錯棍郎，反正就是安不了，就用不得银室，所以就放棄了涂佃。問了R包的作者，和我說他也安不上蜈敢，上傳到biocondutor之后他也沒有權(quán)限了辜荠，讓我別用了。我就放棄了抓狭。不過找到了Agbase這個網(wǎng)站伯病，很不錯。
到網(wǎng)站http://www.bioconductor.org/help/search/index.html?q=clusterprofiler/否过，選擇最新發(fā)布的版本午笛。
后續(xù)按照圖中的提示，在Rstudio 的console輸入命令苗桂。
if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
? ? install.packages("BiocManager")
BiocManager::install("clusterProfiler")
安裝完成药磺，順便學(xué)習(xí)了BiocManager::install("R包名")命令，一般這是最方便的安裝煤伟。
