前言
俗話說“文獻(xiàn)是最好的老師”,但是隔行如隔山吕晌,在科研界,隔著一個(gè)領(lǐng)域就有一個(gè)巨大的鴻溝临燃。就比如就算做腫瘤研究的人睛驳,看免疫學(xué)領(lǐng)域的文章還是會(huì)頭皮發(fā)麻,看到總是記不住的CD4+ T細(xì)胞膜廊,CD8+ T細(xì)胞乏沸,各種CD分子就能讓人頭禿。不做表觀遺傳的人溃论,看到甲基化屎蜓,泛素化,乙踉垦化就害怕的想往后退炬转。但學(xué)習(xí)的過程,就是把自己那膽小的腦細(xì)胞安撫一下算灸,客服困難后獲取知識(shí)的感覺如沐春風(fēng)扼劈。
m6A甲基化,咋一聽名字我就是拒絕的菲驴。甲基化我可以理解荐吵,m6A又是什么?它的功能是什么? m6A甲基化,對我來說就是一張白紙先煎,我除了一個(gè)名字贼涩,全然不知。
以下將是一個(gè)m6A甲基化小白的拆解式了解
本文參考的文章有:RNA甲基化修飾——m6A概念薯蝎,重磅前沿 https://www.ebiotrade.com/newsf/2018-5/201857103154270.htm (這是一篇非常言簡意賅的文章遥倦,請一定要閱讀)
m6A甲基化是什么?
一看到甲基化就想到修飾占锯,這個(gè)原因不加解釋了袒哥。一直以為我從未關(guān)注過中心法則中的RNA,也未考慮過RNA也需要修飾消略。實(shí)際上已知RNA已經(jīng)存在超過100中修飾堡称,下面是我在谷歌中找到的圖
RNA processing begins with the addition of a 5'-cap and a 3'-poly(rA) tail to the pre-mRNA. The protein coding region contains coding sequences called exons. The exons are spliced together to form the mature mRNA.
圖中所示的5’cap和3‘的Poly A尾,就是RNA修飾艺演,加帽和加尾肯定會(huì)使得這條RNA和pre-mRNA的功能有了變化却紧,由此我們聯(lián)想到RNA,也是有不同的變化(狀態(tài))的钞艇。結(jié)合果子老師之前的推文介紹啄寡,我大概了解到,RNA可以從前體變成熟哩照,可以翻譯也可以不翻譯挺物,可以蓄積也可以降解。而m6A甲基化就是一種可以改變RNA狀態(tài)的修飾飘弧。
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這張圖里识藤,m6A甲基化就像是RNA的標(biāo)簽,由WTAP次伶,METTL3和METTL14組成的復(fù)合物寫入痴昧,之后會(huì)由閱讀器過來閱讀從而發(fā)揮作用,不同的閱讀器發(fā)揮的功能不一樣冠王,我們比較熟悉的是YTHDF2赶撰,他閱讀m6A甲基化后促進(jìn)RNA降解。寫入的m6A甲基化如果不擦除會(huì)失調(diào)柱彻,所以還有一些蛋白作為擦除器豪娜,專門擦除m6A甲基化,已知的兩個(gè)是FTO和ALKBH5哟楷。
這張圖解決了瘤载,它是誰,它從哪里來卖擅,將要哪里去的問題
(1)m6A甲基化鸣奔,由Pre-mRNA-splicing regulator WTAP , N6-adenosine-methyltransferase 70 kDa subunit (METTL3) 和METTL14等蛋白寫入墨技。好吧,這些可都是剪接調(diào)節(jié)因子或者甲基轉(zhuǎn)移酶呀挎狸。有甲基化扣汪,自然也就有去甲基化,那么就是通過the first m6A demethylase, fat mass and obesity-associated protein (FTO)伟叛,the 2nd m6A demethylase--m6A demethylase alkB homolog 5 (ALKBH5)起作用私痹。 FTO是第一個(gè)被發(fā)現(xiàn)的m6A去甲基化酶,ALKBH5是第二個(gè)统刮。
(2)m6A甲基化的mRNA,經(jīng)過閱讀器(猜測是核糖體之類的東西账千,如有錯(cuò)誤侥蒙,請不吝賜教)閱讀后,該mRNA可能會(huì)翻譯匀奏,可能會(huì)保持穩(wěn)定不變或者降解鞭衩,可能會(huì)被剪切,可能也會(huì)發(fā)生核轉(zhuǎn)位(出核)
(3)既然m6A甲基化對蛋白表達(dá)娃善、剪接體的形成還有mRNA定位都有重大影響论衍,這就預(yù)示著m6A甲基化會(huì)對非常多的生物學(xué)過程具有重要意義。
看到這里聚磺,不由的點(diǎn)點(diǎn)頭坯台,嗯,m6A甲基化真的很重要呢瘫寝!