利用可逆性組織蛋白酶B抑制劑gfg -醛縮氨基脲假褪，用親和層析法純化了日本血吸蟲(chóng)組織蛋白酶B樣蛋白酶Sj31呻右，并從瘧原蟲(chóng)中分離出了惡性瘧原蟲(chóng)傲隶。
編號(hào): 200138
中文名稱: 三肽Gly-Phe-Gly-aldehyde
CAS號(hào): 102579-48-6
單字母: H2N-GFG-CHO
三字母: H2N-Gly-Phe-Gly-CHO
氨基酸個(gè)數(shù): 3
分子式: C13H17N3O3
平均分子量: 263.29
精確分子量: 263.13
等電點(diǎn)(PI): -
pH=7.0時(shí)的凈電荷數(shù): 0.97
平均親水性: -2.5
疏水性值: 0.67
來(lái)源: 人工化學(xué)合成英上，僅限科學(xué)研究使用祟峦，不得用于人體罚斗。
儲(chǔ)存條件: 負(fù)80℃至負(fù)20℃
標(biāo)簽: 醛肽 抑制劑相關(guān)肽 三肽
參考文獻(xiàn)：
- 定義
- 酶是用于生化反應(yīng)的非常有效的催化劑。它們通過(guò)提供較低活化能的替代反應(yīng)途徑來(lái)加快反應(yīng)速度宅楞。酶作用于底物并產(chǎn)生產(chǎn)物针姿。一些物質(zhì)降低或什至停止酶的催化活性被稱為抑制劑。
- 發(fā)現(xiàn)
- 1965年厌衙，Umezawa H分析了微生物產(chǎn)生的酶抑制劑距淫，并分離出了抑制亮肽素和抗痛藥的胰蛋白酶和木瓜蛋白酶，乳糜蛋白酶抑制的胰凝乳蛋白酶婶希，胃蛋白酶抑制素抑制胃蛋白酶溉愁，泛磷酰胺抑制唾液酸酶，烏藤酮抑制酪氨酸羥化酶，多巴汀抑制多巴胺3-羥硫基嘧啶和多巴胺3-羥色胺酶酪氨酸羥化酶和多巴胺J3-羥化酶拐揭。最近撤蟆，一種替代方法已應(yīng)用于預(yù)測(cè)新的抑制劑：合理的藥物設(shè)計(jì)使用酶活性位點(diǎn)的三維結(jié)構(gòu)來(lái)預(yù)測(cè)哪些分子可能是抑制劑1。已經(jīng)開(kāi)發(fā)了用于識(shí)別酶抑制劑的基于計(jì)算機(jī)的方法堂污，例如分子力學(xué)和分子對(duì)接家肯。
- 結(jié)構(gòu)特征
- 已經(jīng)確定了許多抑制劑的晶體結(jié)構(gòu)。已經(jīng)確定了三種與凝血酶復(fù)合的高效且選擇性的低分子量剛性肽醛醛抑制劑的晶體結(jié)構(gòu)盟猖。這三種抑制劑全部在P3位置具有一個(gè)新的內(nèi)酰胺部分讨衣，而對(duì)胰蛋白酶選擇性最高的兩種抑制劑在P1位置具有一個(gè)與S1特異性位點(diǎn)結(jié)合的胍基哌啶基。凝血酶的抑制動(dòng)力學(xué)從慢到快變化式镐，而對(duì)于胰蛋白酶反镇，抑制的動(dòng)力學(xué)在所有情況下都快。根據(jù)兩步機(jī)理2中穩(wěn)定過(guò)渡態(tài)絡(luò)合物的緩慢形成來(lái)檢驗(yàn)動(dòng)力學(xué)娘汞。
- 埃米爾?菲舍爾（Emil Fischer）在1894年提出歹茶，酶和底物都具有特定的互補(bǔ)幾何形狀，彼此恰好契合你弦。這稱為“鎖和鑰匙”模型3惊豺。丹尼爾·科什蘭（Daniel Koshland）提出了誘導(dǎo)擬合模型，其中底物和酶是相當(dāng)靈活的結(jié)構(gòu)禽作，當(dāng)?shù)孜锱c酶4相互作用時(shí)尸昧，活性位點(diǎn)通過(guò)與底物的相互作用不斷重塑。
- 在眾多生物活性肽的成熟過(guò)程中旷偿，需要由其谷氨酰胺（或谷氨酰胺）前體形成N末端焦谷氨酸（pGlu）烹俗。游離形式并與底物和三種咪唑衍生抑制劑結(jié)合的人QC的結(jié)構(gòu)揭示了類似于兩個(gè)鋅外肽酶的α/β支架，但有多個(gè)插入和缺失萍程，特別是在活性位點(diǎn)區(qū)域衷蜓。幾種活性位點(diǎn)突變酶的結(jié)構(gòu)分析為針對(duì)QC相關(guān)疾病5的抑制劑的合理設(shè)計(jì)提供了結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)。
- 作用方式
- 酶是催化化學(xué)反應(yīng)的蛋白質(zhì)尘喝。酶與底物相互作用并將其轉(zhuǎn)化為產(chǎn)物。抑制劑的結(jié)合可以阻止底物進(jìn)入酶的活性位點(diǎn)和/或阻止酶催化其反應(yīng)斋陪。抑制劑的種類繁多朽褪，包括：非特異性，不可逆无虚，可逆-競(jìng)爭(zhēng)性和非競(jìng)爭(zhēng)性缔赠。可逆抑制劑 以非共價(jià)相互作用（例如疏水相互作用，氫鍵和離子鍵）與酶結(jié)合友题。非特異性抑制方法包括最終使酶的蛋白質(zhì)部分變性并因此不可逆的任何物理或化學(xué)變化嗤堰。特定抑制劑 對(duì)單一酶發(fā)揮作用。大多數(shù)毒藥通過(guò)特異性抑制酶發(fā)揮作用度宦。競(jìng)爭(zhēng)性抑制劑是任何與底物的化學(xué)結(jié)構(gòu)和分子幾何結(jié)構(gòu)非常相似的化合物踢匣。抑制劑可以在活性位點(diǎn)與酶相互作用告匠，但是沒(méi)有反應(yīng)發(fā)生。非競(jìng)爭(zhēng)性抑制劑是與酶相互作用但通常不在活性位點(diǎn)相互作用的物質(zhì)离唬。非競(jìng)爭(zhēng)性抑制劑的凈作用是改變酶的形狀后专，從而改變活性位點(diǎn)，從而使底物不再能與酶相互作用而產(chǎn)生反應(yīng)输莺。非競(jìng)爭(zhēng)性抑制劑通常是可逆的戚哎。不可逆抑制劑與酶形成牢固的共價(jià)鍵。這些抑制劑可以在活性位點(diǎn)附近或附近起作用嫂用。
- 功能
- 工業(yè)應(yīng)用中型凳， 酶在商業(yè)上被廣泛使用，例如在洗滌劑嘱函，食品和釀造工業(yè)中甘畅。蛋白酶用于“生物”洗衣粉中，以加速蛋白質(zhì)在諸如血液和雞蛋等污漬中的分解实夹。商業(yè)上使用酶的問(wèn)題包括：它們是水溶性的橄浓，這使得它們難以回收，并且一些產(chǎn)物可以抑制酶的活性（反饋抑制）亮航。
- 藥物分子荸实，許多藥物分子都是酶抑制劑，藥用酶抑制劑通常以其特異性和效力為特征缴淋。高度的特異性和效力表明該藥物具有較少的副作用和較低的毒性准给。酶抑制劑在自然界中發(fā)現(xiàn)，并且也作為藥理學(xué)和生物化學(xué)的一部分進(jìn)行設(shè)計(jì)和生產(chǎn)6重抖。
- 天然毒物 通常是酶抑制劑露氮，已進(jìn)化為保護(hù)植物或動(dòng)物免受天敵的侵害。這些天然毒素包括一些已知最劇毒的化合物钟沛。
- 神經(jīng)氣體（ 例如二異丙基氟磷酸酯（DFP））通過(guò)與絲氨酸的羥基反應(yīng)生成酯畔规，從而抑制了乙酰膽堿酯酶的活性位點(diǎn)。
- 參考
- 1恨统、Scapin G (2006). Structural biology and drug discovery. Curr. Pharm. Des., 12(17):2087–2097.
- 2叁扫、Krishnan R, Zhang E, Hakansson K, Arni RK, Tulinsky A, Lim-Wilby MS, Levy OE, Semple JE, Brunck TK (1998). Highly selective mechanism-based thrombin inhibitors: structures of thrombin and trypsin inhibited with rigid peptidyl aldehydes. Biochemistry, 37 (35):12094-12103.
- 3、Fischer E (1894). Einfluss der configuration auf die wirkung der enzyme. Ber. Dt. Chem. Ges., 27:2985–2993.
- 4畜埋、Koshland DE (1958). Application of a theory of enzyme specificity to protein synthesis. PNAS., 44 (2):98–104.
- 5莫绣、Huang KF, Liu YL, Cheng WJ, Ko TP, Wang AH (2005). Crystal structures of human glutaminyl cyclase, an enzyme responsible for protein N-terminal pyroglutamate formation. PNAS., 102(37):13117-13122.
- 6、Holmes CF, Maynes JT, Perreault KR, Dawson JF, James MN (2002). Molecular enzymology underlying regulation of protein phosphatase-1 by natural toxins. Curr Med Chem., 9(22):1981-1989.
