今天介紹一種環(huán)狀RNA方向二區(qū)SCI發(fā)文思路盈电，作者研究的是xxx環(huán)狀RNA通過吸附xxx miRNA促進(jìn)xxx基因的表達(dá)激活了xxx信號通路叫编，從而發(fā)揮xxx作用（ceRNA調(diào)控機制）。這篇文章發(fā)表在Cell Death & Disease上缨恒，影響因子：6.3能曾，中科院最新分區(qū)：二區(qū)，屬于OA期刊肿轨，需要收取版面費寿冕，不在中科院發(fā)布的國際預(yù)警期刊名單上。
文章題目：Hsa_circ_0110757?upregulates?ITGA1?to facilitate temozolomide resistance in glioma by suppressing?hsa-miR-1298-5p
分析內(nèi)容：
1椒袍、作者收集相關(guān)的TMZ-resistant GBM臨床樣本組織進(jìn)行RNA-seq測序找出具有差異的環(huán)狀RNA（TMZ-resistant vs TMZ-sensitive）驼唱，作者主要對上調(diào)的環(huán)狀RNA比較感興趣，然后使用RT-PCR進(jìn)行驗證驹暑，發(fā)現(xiàn)hsa_circ_0110757?的表達(dá)上調(diào)最顯著玫恳，并且在相關(guān)細(xì)胞系中得到驗證辨赐。
2、通過相關(guān)體外實驗證實hsa_circ_0110757會促進(jìn)TMZ resistance京办。
3掀序、作者通過miRanda、PITA惭婿、 RNAhybrid三個網(wǎng)站預(yù)測hsa_circ_0110757下游的miRNA不恭，相關(guān)實驗證據(jù)表明hsa_circ_0110757是通過吸附 hsa-miR-1298-5p發(fā)揮作用。
4财饥、通過microRNA换吧、TargetScanVert、miRDB 網(wǎng)站預(yù)測hsa-miR-1298-5p下游的靶基因钥星，通過相關(guān)篩選最后發(fā)現(xiàn)ITGA1是hsa-miR-1298-5p下游調(diào)控的靶基因沾瓦。
5、
hsa_circ_0110757/hsa-miR-1298-5p/ITGA1這樣的ceRNA調(diào)控機制已經(jīng)找到了谦炒，然后就是探索ITGA1相關(guān)的信號通路贯莺，最后發(fā)現(xiàn)是PI3K/AKT信號通路，相關(guān)的作用機制也就得到了解釋：hsa_circ_0110757通過吸附hsa-miR-1298-5p促進(jìn) ITGA1的表達(dá)激活了PI3K/AKT信號通路宁改，從而促進(jìn)了GBM的TMZ resistance缕探。
6、通過體內(nèi)實驗證實hsa_circ_0110757會促進(jìn)TMZ resistance透且。
上面的內(nèi)容可以歸納在一張圖上撕蔼，如下圖：
總結(jié)：ceRNA是近幾年的研究熱點，雖然現(xiàn)在熱度是下降了秽誊，不過仍然有很多人在做這樣的ceRNA基礎(chǔ)科研鲸沮，因為這樣的套路比較成熟，論是實驗設(shè)計還是相關(guān)操作可行性都是比較高的锅论。這篇是通過測序篩選出差異的環(huán)狀RNA讼溺，不過臨床樣本有點少，只有10個（5 vs 5）最易，與那些一兩百個樣本的測序篩選差遠(yuǎn)了怒坯。當(dāng)然這個還要考慮課題組的經(jīng)費問題，不是每個課題組都有這么多經(jīng)費測序藻懒，也不是每一個課題組都能收集到這么多臨床樣本剔猿。但是有些審稿人并不會考慮這些，而是只會讓你補充臨床樣本測序嬉荆，如果要是遇到這樣的審稿人就麻煩了归敬。除了自己收集臨床樣本測序進(jìn)行篩選外，還可以利用GEO數(shù)據(jù)挖掘的方法篩選或者利用GEO數(shù)據(jù)來驗證也行。
