轉(zhuǎn)錄組學習

conda create -n rna_seq 安裝軟件

經(jīng)過質(zhì)控后逢勾，采用STAR進行比對

雖然做的是無參轉(zhuǎn)錄組碱鳞，但是別人提供的同一物種的reference genome組裝質(zhì)量還可以，所以考慮Trinity genome guide的組裝方式，同時也做了de novo assemble進行了比較。

查找Trinity.fasta的ORF官份，因為Trinity的輸出不都是以O(shè)RF開始。

eggnog對ORF預測結(jié)果進行同源注釋

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