龍舌蘭根際細(xì)菌多樣性和相互作用網(wǎng)絡(luò)與Cuatro Cienegas寡養(yǎng)盆地塊狀土的顯著差異
Nguyen E. López-Lozano1*,?Andrea Echeverría Molinar1,?Elizabeth Alejandra Ortiz Durán2,?Maribel Hernández Rosales3??and?Valeria Souza4
統(tǒng)計(jì)分析Shapiro-Wilk檢驗(yàn)用于檢驗(yàn)數(shù)據(jù)的正常性。如果沒有正態(tài)分布，則應(yīng)用數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換吱肌。使用Pearson方法進(jìn)行土壤物理化學(xué)性質(zhì)的自相關(guān)分析。然而革砸，沒有一個(gè)屬性呈現(xiàn)出顯著的自相關(guān)。之后糯累，為了尋找土壤類型（根際或塊狀土壤）和季節(jié)之間的差異算利，以及兩個(gè)變量之間的相互作用，使用雙向ANOVA寇蚊。為了驗(yàn)證模型擬合笔时，評(píng)估了殘差的正態(tài)性假設(shè)。作為對(duì)那些表現(xiàn)出顯著差異的屬性的事后評(píng)估仗岸，應(yīng)用了Tukey測(cè)試。這些分析是使用R軟件v 3.4.0進(jìn)行的借笙。扒怖，用于所有后續(xù)分析。使用基于Bray-Curtis相異指數(shù)的非度量多維標(biāo)度（NMDS）方法進(jìn)行排序分析业稼，對(duì)于所有分析盗痒，僅考慮相對(duì)豐度大于1%的屬。應(yīng)用非生物變量的環(huán)境擬合分析（土壤的物理化學(xué)性質(zhì)）低散。這些計(jì)算是用純素包裝和ggplot2包裝進(jìn)行的俯邓。使用gplots包構(gòu)建熱圖，其聚類分析基于Bray-Curtis不相似性指數(shù)熔号。PERMANOVA分析使用純素包裝中的功能adonis2進(jìn)行稽鞭。
