文獻(xiàn)信息：
標(biāo)題：Large field of view-spatially resolved transcriptomics at nanoscale resolution
中文：納米級分辨率的大視野空間分辨轉(zhuǎn)錄組學(xué)
短標(biāo)題：DNA nanoball stereo-sequencing / DNA納米球空間測序
單位：BGI深圳
時(shí)間：2021.1.17
摘要：
原位基因表達(dá)的高通量分析代表了對組織復(fù)雜性的系統(tǒng)理解的重大進(jìn)展。在具有足夠捕獲面積和高樣品通量的情況下應(yīng)用贮缕，將有助于定義組織和生物體中基因表達(dá)的時(shí)空動(dòng)態(tài)陪蜻。然而豫领，當(dāng)前的技術(shù)具有相當(dāng)大的瓶頸闪湾，限制了廣泛的應(yīng)用昵时。在這里早处，我們結(jié)合了DNA納米球（DNB）模式的陣列芯片和原位RNA捕獲技術(shù)湾蔓，開發(fā)了Stereo-seq（時(shí)空增強(qiáng)分辨分辨率Omics測序）。這種方法可以以前所未有的（納米級）分辨率對組織切片進(jìn)行高通量的轉(zhuǎn)錄組分析砌梆，其面積可擴(kuò)展至厘米級默责，高靈敏度和均一的捕獲率。作為原理證明咸包，我們將Stereo-seq應(yīng)用于成年小鼠的大腦和E11.5和E16.5小鼠胚胎的矢狀切面桃序。憑借其獨(dú)特的功能和對其他修飾的適應(yīng)性，Stereo-seq可以為組織和生物體的系統(tǒng)化空間分辨組學(xué)表征鋪平道路诉儒。
1 stereo-seq圖示
2 stereo-seq從復(fù)雜組織中捕獲RNA的改善
3 時(shí)空組測序以前所未有的分辨率解析小鼠大腦轉(zhuǎn)錄組結(jié)構(gòu)
4 stereo-seq重建發(fā)育中的小鼠胚胎的時(shí)空基因表達(dá)動(dòng)態(tài)
sup1 stereo-seq芯片大小和重復(fù)率評估（圖2）
sup2 stereo-seq的穩(wěn)健性（圖2）
sup3 不同技術(shù)檢測的小鼠嗅球表達(dá)熱圖（圖2）
sup4 stereo-seq檢測不同的小鼠大腦解剖結(jié)構(gòu)（圖3）
sup5 stereo-seq檢測小鼠胚胎在不同發(fā)育階段的結(jié)構(gòu)
sup6 stereo-seq解析與小鼠嗅球發(fā)育有關(guān)的結(jié)構(gòu)特征基因表模式達(dá)（圖4）
sup7 stereo-seq發(fā)現(xiàn)小鼠嗅球發(fā)育動(dòng)態(tài)基因表達(dá)模式
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新組學(xué)技術(shù) | Stereo-seq：大視場納米級分辨率時(shí)空組學(xué)技術(shù)
