384孔熒光定量(qRT-PCR)實驗優(yōu)化方案

Author:J.F.XIE
Date:23-03-2021

384孔熒光定量的普及懊渡,使得批量檢測基因變得更加便捷笋除、高效袜爪,極大地提升了實驗效率。傳統(tǒng)手動加樣需保持精神高度集中娜搂,初學(xué)者往往因為移液操作不熟練導(dǎo)致加樣不均迁霎,加樣錯孔更導(dǎo)致實驗失敗,種種弊端制約了熒光檢測的效率百宇。在當前實驗室條件下考廉,通過采用專用的設(shè)備耗材,進行合理的排版和運算携御,即可實現(xiàn)批量操作昌粤,下文給出具體方案。

專用設(shè)備耗材三件套:

A:ABI 384 PCR板:

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B:八聯(lián)排移液器:

img

C:巴洛克加樣槽


image.png

image.png

1. 384PCR反應(yīng)體系:

cDNA 2ul
F/R Primer 0.4ul
SYBR Mix 5ul
H2O 2.2ul

2. 添加預(yù)混液(引物因痛、Mix和H2O)

常規(guī)的排槍為8Tips婚苹,其間距與96孔板、10ul槍頭座間距相一致鸵膏;
而384孔間距為正常PCR板的1/2膊升。
因此,加樣時候谭企,必須間隔一孔加樣廓译。
由于移液損失等原因评肆,手動加樣建議"滿10添1",而排槍加樣建議"滿6添1"(筆者經(jīng)驗)非区。

例如瓜挽,熒光檢測RNAi干擾Vg基因,EGFP做對照征绸,每個處理6個生物重復(fù)久橙,3個技術(shù)復(fù)孔。
(2樣本*6重復(fù)*3復(fù)孔)+(2樣本*6重復(fù)*3復(fù)孔)/6=42
42孔*8ul=336ul
首先按照反應(yīng)體系配置預(yù)混液管怠,均勻分裝到12孔加樣槽內(nèi)(此處只用到了6槽)淆衷,每槽加樣56ul,然后使用排槍將預(yù)混液依次加入到對應(yīng)的384孔內(nèi)渤弛。當總預(yù)混液體積少時更推薦用酶標板或八聯(lián)排PCR管祝拯。
然后同樣操作加入cDNA樣。

3. 排版示意圖及操作:

image.png

Step1.
添加內(nèi)參預(yù)混液她肯,黃色色塊佳头;


image.png

Step2.
添加內(nèi)參預(yù)混液,紅色色塊晴氨;


image.png

Step3.
添加檢測基因Vg預(yù)混液康嘉,深藍色色塊;


image.png

Step4.
添加檢測基因Vg預(yù)混液瑞筐,紫色色塊凄鼻;


image.png

Step5.
cDNA稀釋液按照對應(yīng)次序排列,切記間隔加樣聚假。依次按照預(yù)混液加樣順序块蚌,添加模板cDNA即可。


image.png

評價:

  1. 傳統(tǒng)加樣耗時費力膘格,對操作技巧峭范、體力等有較高要求。如果環(huán)境溫度過高瘪贱,加樣周期長纱控,部分液體揮發(fā),導(dǎo)致復(fù)孔之間差異較大菜秦,為后續(xù)分析帶來不便甜害。視野在模板和加樣孔之間來回切換,容易視覺疲勞球昨,導(dǎo)致加樣錯誤尔店。

  2. 較傳統(tǒng)手動單孔加樣,排槍加樣只需要提前計算好加樣體積,并將預(yù)混好的反應(yīng)液提前分裝到加樣槽內(nèi)嚣州,然后間隔加樣鲫售。計算好體系,依次按照排版加樣该肴,效率顯著提升情竹,并且避免手動加樣錯位,復(fù)孔之間重復(fù)性更穩(wěn)定匀哄,結(jié)果更穩(wěn)健秦效。

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