前言
在前面的一講內(nèi)容里(單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)階分析—《細(xì)胞通訊》2.1CellChat基礎(chǔ)分析教程)我們已經(jīng)給大家介紹了CellChat單樣本數(shù)據(jù)處理的實(shí)操校翔。本講的內(nèi)容主要向大家展示如何挖掘細(xì)胞通訊在不同組別中的差異。本次課程所涉及的代碼洽胶、測(cè)試文件在公眾號(hào)后臺(tái)中回復(fù)“CellChat多組別分析”獲取瓢阴。后續(xù)的代碼如果不出意外都會(huì)在西柚云服務(wù)器中演示(做生信络拌,如果你還在為電腦配置而煩惱鬼癣。網(wǎng)址:西柚云生信共享服務(wù)器 )。
視頻教程
單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)階分析—《細(xì)胞通訊》2.2CellChat多組別分析
往期回顧
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保姆級(jí)教程 《手把手教你做單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析》
單細(xì)胞測(cè)序基礎(chǔ)數(shù)據(jù)分析保姆級(jí)教程老赤,代碼部分整理在往期推送之中:
手把手教你做單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析(一)——緒論
手把手教你做單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析(二)——各類輸入文件讀取
手把手教你做單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析(三)——單樣本分析
手把手教你做單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析(四)——多樣本整合
手把手教你做單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析(五)——細(xì)胞類型注釋
手把手教你做單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析(六)——組間差異分析及可視化
手把手教你做單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析(七)——基因集富集分析
上游fastq文件處理:
單細(xì)胞分析的最上游——處理Fastq文件:cellranger
單細(xì)胞分析的最上游——處理Fastq文件:dropseqRunner
細(xì)胞通訊
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往期推送
單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)階分析—《細(xì)胞通訊》1.概論
單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)階分析—《細(xì)胞通訊》2.1CellChat基礎(chǔ)分析教程
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答讀者問(wèn)(三):?jiǎn)渭?xì)胞測(cè)序前景
答讀者問(wèn)(六):Seurat中如何讓細(xì)胞聽你指揮
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單細(xì)胞文獻(xiàn)閱讀:
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非技術(shù)帖:
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