單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)階分析—《細(xì)胞通訊》2.2CellChat多組別分析

前言

在前面的一講內(nèi)容里(單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)階分析—《細(xì)胞通訊》2.1CellChat基礎(chǔ)分析教程)我們已經(jīng)給大家介紹了CellChat單樣本數(shù)據(jù)處理的實(shí)操校翔。本講的內(nèi)容主要向大家展示如何挖掘細(xì)胞通訊在不同組別中的差異。本次課程所涉及的代碼洽胶、測(cè)試文件在公眾號(hào)后臺(tái)中回復(fù)“CellChat多組別分析”獲取瓢阴。后續(xù)的代碼如果不出意外都會(huì)在西柚云服務(wù)器中演示(做生信络拌,如果你還在為電腦配置而煩惱鬼癣。網(wǎng)址:西柚云生信共享服務(wù)器 )。



視頻教程

單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)階分析—《細(xì)胞通訊》2.2CellChat多組別分析



往期回顧

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保姆級(jí)教程 《手把手教你做單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析》

單細(xì)胞測(cè)序基礎(chǔ)數(shù)據(jù)分析保姆級(jí)教程老赤,代碼部分整理在往期推送之中:

手把手教你做單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析(一)——緒論

手把手教你做單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析(二)——各類輸入文件讀取

手把手教你做單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析(三)——單樣本分析

手把手教你做單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析(四)——多樣本整合

手把手教你做單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析(五)——細(xì)胞類型注釋

手把手教你做單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析(六)——組間差異分析及可視化

手把手教你做單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析(七)——基因集富集分析

上游fastq文件處理:

單細(xì)胞分析的最上游——處理Fastq文件:cellranger

單細(xì)胞分析的最上游——處理Fastq文件:dropseqRunner

細(xì)胞通訊

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往期推送

單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)階分析—《細(xì)胞通訊》1.概論

單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)階分析—《細(xì)胞通訊》2.1CellChat基礎(chǔ)分析教程

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文獻(xiàn)閱讀系列(十二)、IgAN & STRT-Seq

非技術(shù)帖:

關(guān)于單細(xì)胞的事 談?wù)労竺娴挠?jì)劃

Biomamba助推的第一篇論文發(fā)表啦



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