前言
在前面的一講內(nèi)容里(單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)進(jìn)階分析—《細(xì)胞通訊》1.概論)我們已經(jīng)給大家介紹了細(xì)胞通訊的基本概念饥臂。本講的內(nèi)容主要是帶領(lǐng)大家走一遍CellChat最基礎(chǔ)的workflow淌喻，類似于我們學(xué)習(xí)Seurat時(shí)的“單樣本分析”部分趣斤，旨在向大家介紹CellChat的基本語法、用法及功能累魔。本次課程所涉及的代碼狸膏、測試文件在公眾號(hào)后臺(tái)中回復(fù)“CellChat.P1”獲取帕涌。后續(xù)的代碼如果不出意外都會(huì)在西柚云中制作（https://www.xiyoucloud.net/aff/UPWEQQBD）地消。
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Cellchat基礎(chǔ)分析代碼結(jié)果一覽：
單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)進(jìn)階分析—《細(xì)胞通訊》2.1CellChat基礎(chǔ)分析
往期回顧
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保姆級(jí)教程 《手把手教你做單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)分析》
保姆級(jí)教程，代碼部分整理在往期推送之中：
手把手教你做單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)分析（一）——緒論
手把手教你做單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)分析（二）——各類輸入文件讀取
手把手教你做單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)分析（三）——單樣本分析
手把手教你做單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)分析（四）——多樣本整合
手把手教你做單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)分析（五）——細(xì)胞類型注釋
手把手教你做單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)分析（六）——組間差異分析及可視化
手把手教你做單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)分析（七）——基因集富集分析
上游fastq文件處理：
單細(xì)胞分析的最上游——處理Fastq文件：cellranger
單細(xì)胞分析的最上游——處理Fastq文件：dropseqRunner
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答讀者問（八）：為什么Read10X也會(huì)報(bào)錯(cuò)?
答讀者問（十）整合后的表達(dá)矩陣机杜，如何拆分出分組信息？
答讀者問（十一）如何一次性讀取一個(gè)目錄下的cellranger輸出文件溺森？
單細(xì)胞文獻(xiàn)閱讀：
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文獻(xiàn)閱讀系列（十一）、高氧下小鼠肺發(fā)育損傷的ScRNA圖譜
文獻(xiàn)閱讀系列（十二）伸但、IgAN & STRT-Seq
非技術(shù)帖：
關(guān)于單細(xì)胞的事 談?wù)労竺娴挠?jì)劃
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