轉錄因子（TF）在動植物的生長發(fā)育及其對外界環(huán)境的反應中起著重要的調控作用。在基因組學和表觀遺傳學研究中楼熄，轉錄因子結合位點（TFBS）的發(fā)掘一直是研究熱點疚察。傳統(tǒng)的染色質免疫共沉淀測序（ChIP-seq）方法运褪，在抗體質量很好的情況下能夠有效檢測到TFBS甥雕。然而踩身，好的抗體可遇不可求，這限制了ChIP-seq更廣泛的應用社露。
2016年挟阻，O'Malley RC等人在Cell上發(fā)表了使用DNA親和純化測序（DNA Affinity Purification sequencing, DAP-seq）技術，快速繪制轉錄因子調控靶向DNA區(qū)域的順反組和表觀組圖譜的文章峭弟。
文獻地址：Cistrome and Epicistrome Features Shape the Regulatory DNA Landscape.
2017年附鸽，Bartlett A等人在Nature Protocols上發(fā)表了DAP-seq的實驗方法。
文獻地址：Mapping genome-wide transcription-factor binding sites using DAP-seq.
DAP-seq技術不僅可以用于模式物種的研究瞒瘸，同樣適用于非模式物種坷备，尤其是植物。因此情臭，DAP-seq技術的出現省撑，使TFBS的研究不再局限于任何生物，不再受抗體質量的限制俯在，為生命科學領域轉錄因子的研究提供了新型高效的工具竟秫。
DAP-seq技術能夠高通量檢測轉錄因子或DNA結合蛋白在基因組上的結合位點，鑒定下游靶基因跷乐。藍景科信可為您提供DAP-seq全流程技術服務和個性化數據分析肥败，具有100多個物種，1000多個轉錄因子的實驗經驗愕提。我們的DAP-seq技術服務馒稍，已助力許多科研院所及高校的客戶成功發(fā)表文章。
實驗流程：
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已做物種：
植物類：擬南芥挨决、莖瘤芥请祖、甘藍型油菜、白菜型油菜脖祈、不結球白菜肆捕、菜心、小麥盖高、大麥慎陵、花生眼虱、辣椒、番茄席纽、草莓捏悬、黃花棘豆、苦蕎润梯、紅薯过牙、木薯、馬鈴薯纺铭、普通煙草寇钉、人參、鴨茅舶赔、罌粟扫倡、甘蔗、短芒大麥草竟纳、二色補血草撵溃、百脈根、芍藥锥累、丹參缘挑、狗尾草、菠菜揩悄、玉米卖哎、大豆鬼悠、高粱删性、藜麥、陸地棉焕窝、甜瓜蹬挺、黃瓜、葡萄它掂、灰氈毛忍冬巴帮、粉葛、三葉青虐秋、獼猴桃榕茧、香蕉、蒺藜苜蓿客给、紫花苜蓿用押、伴礦景天、苔蘚靶剑、地錢蜻拨、毛果楊池充、717楊、84K楊缎讼、小黑楊收夸、胡楊、山新楊血崭、小葉楊卧惜、歐美楊、大青楊夹纫、毛白楊序苏、剛毛檉柳、白樺捷凄、光皮樺忱详、油松、毛竹跺涤、麻竹匈睁、銀杏、油桐桶错、荔枝航唆、柑橘、甜橙院刁、歐洲云杉糯钙、核桃、柿子退腥、閩楠任岸、木荷、臍橙狡刘、板栗享潜、棗、枳嗅蔬、杜梨剑按、蘋果、桃澜术、櫻桃艺蝴、麻瘋樹、茶樹鸟废、梅猜敢、月季、海島棉、白木香锣枝、橡膠樹厢拭、三角褐指藻、芥藍撇叁、藍花耬斗菜供鸠、鹽芥、無花果陨闹、菠蘿楞捂、西瓜、甘薯趋厉、竹葉花椒寨闹、玫瑰。? ??動物類：驢君账、飛蝗繁堡、新孢子蟲、煙粉虱乡数、草地貪夜蛾椭蹄。? ?真菌類：擬輪枝鐮孢菌、豬苓真菌净赴、意大利青霉绳矩、草酸青霉、腐霉玖翅、金黃殼囊孢翼馆、靈芝、糙皮側耳金度、草菇应媚、灰蓋鬼傘、蟲草审姓、亞洲鐮刀菌珍特、蝗綠僵菌祝峻。? ?細菌類：路德維希腸桿菌魔吐、嗜熱厭氧桿菌、生氮假單胞菌莱找、伯克赫爾德氏菌酬姆、布魯氏菌、肺炎克雷伯菌奥溺。
部分文章：
2023年6月16日辞色，濟南大學生物科技與技術學院李慧教授團隊的研究成果，發(fā)表在植物學領域的TOP期刊Plant, Cell & Environment（IF=7.947）浮定，文章題目為“ZmEREB57 regulates OPDA synthesis and enhances salt stress tolerance through two distinct signalling pathways in?Zea mays”相满。該研究使用DNA親和純化測序(DAP-seq)技術鑒定了玉米中一個AP2/ERF轉錄因子的結合基序以及靶基因层亿。揭示了ZmEREB57通過兩個不同的信號途徑調控玉米OPDA合成增強耐鹽性的分子機制，為耐鹽性植物新品種的培育提供了重要的遺傳資源立美。
2023年5月29日匿又，北京林業(yè)大學生物學院林木分子育種團隊的研究成果，發(fā)表在知名學術期刊Plant Physiology（IF=8.005）建蹄，文章題目為“Allelic variation in transcription factor PtoWRKY68 contributes to drought tolerance in Populus”碌更。該研究使用DNA親和純化測序(DAP-seq) 技術鑒定了毛白楊轉錄因子PtoWRKY68的結合基序以及靶基因。揭示了PtoWRKY68基因等位變異通過調控ABA信號通路響應干旱脅迫的分子機制洞慎，為利用分子育種策略開發(fā)耐旱樹木新品種奠定了遺傳基礎痛单。
?2023年4月13日，西北農林科技大學園藝學院王西平教授課題組在Horticulture Research期刊(IF=7.291)在線發(fā)表了題為“Control of ovule development in? Vitis vinifera by? VvMADS28 and interacting genes” 的研究論文劲腿。DAP-seq助力該研究揭示了葡萄MADS-box基因對胚珠發(fā)育的調控機制旭绒。
2023年4月6日，中國中醫(yī)科學院中藥資源中心黃璐琦院士/袁媛研究員課題組的研究成果焦人，發(fā)表在Frontiers in Microbiology期刊上(IF=6.064)快压，文章題目為“PuCRZ1, an C2H2 transcription factor from Polyporus umbellatus, positively regulates mycelium response to osmotic stress”。該研究使用DNA親和純化測序(DAP-seq)技術鑒定了豬苓中一個C2H2轉錄因子的結合基序及其靶基因垃瞧，揭示了PuCRZ1參與調控豬苓菌絲生長以及滲透脅迫耐受的分子機制蔫劣。
2023年3月，華中農業(yè)大學端木德強團隊在New Phytologist期刊（IF=10.323）在線發(fā)表了題為“A transcription factor of the NAC family regulates nitrate-induced legume nodule senescence”的研究論文个从。該研究揭示了豆科植物百脈根中一個NAC轉錄因子在硝酸鹽誘導的根瘤衰老過程中發(fā)揮了關鍵的調控作用脉幢。
2023年2月9日，浙江大學農業(yè)與生物技術學院的最新研究成果嗦锐，發(fā)表在Molecular Plant期刊上(IF=21.949)嫌松，文章題目為“Single-cell transcriptomic analysis reveals the developmental trajectory and transcriptional regulatory networks of pigment glands in?Gossypium bickii”。該研究使用DNA親和純化測序(DAP-seq)技術鑒定了比克氏棉子葉GoPGF的結合基序和下游靶基因奕污。并進一步揭示了比克氏棉色素腺形態(tài)建成的調控網絡萎羔，為培育具有特定性狀的栽培棉花新品種提供了寶貴的基因資源。
2023年1月31日碳默，西北農林科技大學園藝學院蘋果重點實驗室的最新研究成果贾陷，發(fā)表在Plant Physiology期刊上(IF=8.005)，文章題目為“MdERF114 enhances the resistance of apple roots to Fusarium solani by regulating the transcription of MdPRX63”嘱根。該研究使用DNA親和純化測序(DAP-seq)技術鑒定了蘋果MdERF114的結合基序和靶基因髓废。進一步研究揭示了MdERF114正向調控蘋果根系抵御腐皮鐮刀菌侵染的分子機制，為培育抗ADR的砧木提供了寶貴的基因資源该抒。
2023年01月03日慌洪，中南林業(yè)科技大學的最新研究成果，發(fā)表在Communications Biology期刊上(IF=6.548)，文章題目為“The bHLH-zip transcription factor SREBP regulates triterpenoid and lipid metabolisms in the medicinal fungus?Ganoderma lingzhi”冈爹。該研究使用DNA親和純化測序(DAP-seq)技術鑒定了藥用真菌靈芝中bHLH-zip轉錄因子SREBP的結合基序和靶基因涌攻。進一步研究揭示了SREBP調控靈芝中三萜類化合物和脂質代謝的分子機制，為提高靈芝物種的GA產量提供了寶貴的基因資源频伤。
2022年12月21日癣漆，中國農業(yè)科學院棉花研究所的研究成果發(fā)表在Plant Physiology期刊上(IF=8.005)，文章題目為“A brassinosteroid transcriptional regulatory network participates in regulating fiber elongation in cotton”剂买。該研究使用DNA親和純化測序(DAP-seq)技術鑒定了陸地棉中BR信號通路核心轉錄因子GhBES1.4的結合基序和靶基因惠爽。揭示了GhBES1.4介導的BR調控棉纖維伸長的網絡，為培育陸地棉優(yōu)質纖維新品種提供了寶貴的基因資源瞬哼。
2022年10月婚肆，浙江大學農業(yè)與生物技術學院宋鳳鳴課題組的最新研究成果，發(fā)表在知名學術期刊Journal of Integrative Plant Biology（IF=9.106）上坐慰，文章題目為“The NAC transcription factor ONAC083 negatively regulates rice immunity against Magnaporthe oryzae by directly activating transcription of the RING-H2 gene OsRFPH2-6”较性。該研究使用DNA親和純化測序(DAP-seq) 技術鑒定了水稻中轉錄因子ONAC083的結合基序和靶基因。進一步研究揭示了OsNAC083通過結合ACGCAA元件影響OsRFPH2-6轉錄结胀，進而負調控水稻對稻瘟病的抗性赞咙。
2022年9月，中國熱帶農業(yè)科學院熱帶生物技術研究所功能基因研究組在權威雜志Plant Biotechnology Journal（IF=13.263）在線發(fā)表了題為 “A CC-type glutaredoxin, MeGRXC3, associates with catalases and negatively regulates drought tolerance in cassava (Manihot esculenta Crantz)” 的研究論文糟港，證實了CC類谷氧還蛋白MeGRXC3可以在轉錄和轉錄后水平調控過氧化氫酶的活性攀操、影響過氧化氫在葉片表皮不同類型細胞中的分布，從而調控木薯對干旱脅迫的響應秸抚。
2022年8月速和，廣西大學農學院甘蔗生物學重點實驗室/亞熱帶農業(yè)生物資源保護與利用國家重點實驗室張木清/姚偉研究團隊在Journal of Experimental Botany（IF=7.298）在線發(fā)表了題為“ScAIL1 modulates plant defense responses by targeting DELLA and regulating GA and JA signaling”的研究論文，該研究發(fā)現了一個甘蔗新的AP2家族轉錄因子ScAIL1剥汤，通過靶向DELLA調節(jié)JA與GA合成颠放，平衡植物生長與防御。
2022年8月吭敢，安徽農業(yè)大學碰凶、中國水稻研究所和上海市農業(yè)科學院作物育種栽培研究所在The Plant Journal（IF=5.726）期刊聯合發(fā)表了題為“OsSGT1 promotes melatonin-ameliorated seed tolerance to chromium stress by affecting the OsABI5-OsAPX1 transcriptional module in rice”的文章，揭示了OsSGT1和ABI5相互作用鹿驼，調控OsAPX1的表達欲低，促進褪黑素改善種子在鉻污染條件下萌發(fā)的分子機制。
2022年8月蠢沿，揚州大學生物科學與技術學院伸头、植物功能基因組學教育部重點實驗室高勇課題組在The Plant Cell（IF=12.085）上在線發(fā)表了題為“Phytochrome Interacting Factor Regulates Stomatal Aperture by Coordinating Red Light and Abscisic Acid”的研究論文，揭示了光敏色素互作因子（phytochrome interacting factors, PIFs）通過協(xié)調紅光和脫落酸（ABA）信號調節(jié)氣孔開度的分子機制舷蟀。
2022年7月，北京市農林科學院玉米DNA指紋及分子育種北京市重點實驗室、齊魯師范大學玉米分子育種研究院的共同研究成果野宜，在國際知名學術期刊Theoretical and Applied Genetics(IF=5.574)上發(fā)表扫步，題目為“ A newly characterized allele of ZmR1 increases anthocyanin content in whole maize plant and the regulation mechanism of diferent ZmR1 alleles”。本文主要研究內容是鑒定了玉米花青素合成相關等位基因ZmR1CQ01匈子，并揭示了3個ZmR1等位基因的生物學功能和分子調控機制河胎。
2022年5月，中科院植物所王雷研究組在Plant Physiology（IF=8.005）期刊上發(fā)表了題為“Rice CIRCADIAN CLOCK ASSOCIATED1 transcriptionally regulates ABA signaling to confer multiple abiotic stress tolerance”的研究成果虎敦。該研究揭示了OsCCA1調控水稻適應鹽脅迫游岳、干旱脅迫以及滲透脅迫的分子機制。其中其徙，該研究使用了DNA親和純化測序技術（DAP-seq胚迫，DNA Affinity Purification Sequencing），鑒定了水稻生物鐘核心組分OsCCA1（Oryza sativa CIRCADIAN CLOCK ASSOCIATED 1）調控的下游靶基因唾那。
2022年2月访锻，北京林業(yè)大學生物科學與技術學院林木育種國家工程實驗室的研究成果，發(fā)表在Frontiers in Plant Science期刊上(IF=6.627)闹获，文章題目為“Genome-Wide Identification of Direct Targets of ZjVND7 Reveals the Putative Roles of Whole-Genome Duplication in Sour Jujube in Regulating Xylem Vessel Differentiation and Drought Tolerance”期犬。該研究使用DNA親和純化測序(DAP-seq)技術分別鑒定了二倍體酸棗和同源四倍體酸棗中ZjVND7的結合基序和靶基因。揭示了ZjVND7在調節(jié)木質部導管分化和耐旱性中的潛在分子機制避诽，為培育耐旱性植物提供了新的思路龟虎。
2021年4月29日，重慶文理學院園林與生命科學學院陳澤雄教授的研究成果沙庐，發(fā)表在植物科學領域的知名學術期刊Plant Science（IF=5.363）上遣总，文章題目為“A R2R3-MYB transcriptional activator LmMYB15 regulates chlorogenic acid biosynthesis and phenylpropanoid metabolism in Lonicera macranthoides”。該研究使用DNA親和純化測序(DAP-seq) 技術鑒定了金銀花R2R3-MYB轉錄因子LmMYB15的DNA結合基序及其靶基因轨功。進一步研究揭示了LmMYB15調控金銀花CGA生物合成和苯丙素代謝的分子機制旭斥，該研究成果為利用基因工程策略開發(fā)富含CGA的金銀花新品種提供了寶貴的基因資源。
2020年4月古涧，北京工商大學與藍景科信合作垂券，在Biochemical and Biophysical Research Communications（IF=3.322）發(fā)表了題為“ Phytochrome-interacting factors regulate seedling growth through ABA signaling”的文章，為揭示PIFs轉錄因子調控ABA信號轉導機制提供了重要線索羡滑。
2019年9月菇爪，北京林業(yè)大學和藍景科信合作，在植物學主流學術期刊Journal of Experimental Botany（IF=5.36）上柒昏，發(fā)表了題為“Populus euphratica?WRKY1 binds the promoter of H+-ATPase gene to enhance gene expression and salt tolerance”的研究成果凳宙。該研究借助DNA親和純化測序（DNA Affinity Purification Sequencing，DAP-seq）技術职祷，深入揭示了胡楊耐鹽的分子機制氏涩。
