SDS-PAGE是十二烷基硫酸鈉-聚丙烯酰胺凝膠電泳,是以聚丙烯酰胺凝膠作為支持介質(zhì)的一種常用電泳技術(shù)弃理,用于分離蛋白質(zhì)和寡核苷酸溃论。聚丙烯酰胺凝膠由單體丙烯酰胺和甲叉雙丙烯酰胺聚合而成。其中四甲基乙二胺(TEMED)作為加速劑能催化過硫酸銨產(chǎn)生自由基痘昌。過硫酸銨(APS)作為催化劑產(chǎn)生自由基钥勋,從而引發(fā)丙烯酰胺單體聚合,同時甲叉雙丙烯酰胺與丙烯酰胺鏈間產(chǎn)生甲叉鍵交聯(lián)辆苔,從而形成三維網(wǎng)狀結(jié)構(gòu)算灸。
其中SDS(十二烷基硫酸鈉)是陰離子去污劑,作為變性劑和助溶試劑驻啤,它能斷裂分子內(nèi)和分子間的氫鍵菲驴,使分子去折疊,破壞蛋白分子的二三級結(jié)構(gòu)骑冗。而強還原劑如巰基乙醇赊瞬,二硫蘇糖醇能使半胱氨酸殘基間的二硫鍵斷裂。在樣品和凝膠中加入還原劑和SDS后贼涩,分子被解聚成多肽鏈巧涧,解聚后的氨基酸側(cè)鏈和SDS結(jié)合成蛋白-SDS 膠束,所帶的負(fù)電荷大大超過了蛋白原有的電荷量遥倦,這樣就消除了不同分子間的電荷差異和結(jié)構(gòu)差異谤绳。
SDS-PAGE一般采用的是不連續(xù)緩沖系統(tǒng),與連續(xù)緩沖系統(tǒng)相比袒哥,能夠有較高的分辨率缩筛。之所以會有分離膠和濃縮膠之分,濃縮膠和分離膠的PH值不同统诺,前者主要表現(xiàn)為濃縮效用,后者表現(xiàn)為分子篩效用疑俭。濃縮膠的pH是6.8粮呢,在這個pH條件下,緩沖液中的HCl的Cl離子幾乎全部解離钞艇,Gly的等電點為6.0啄寡,僅少數(shù)解離為負(fù)離子,在電場中移動速度很慢哩照。酸性蛋白質(zhì)在此pH下解離為負(fù)離子挺物,三類離子的遷移速率為Cl>一般蛋白質(zhì)>Gly,電泳開始后飘弧,Cl離子泳動快识藤,在其后留下一個低離子濃度區(qū)砚著。Gly在電場中移動很慢,造成移動離子的缺乏痴昧,于是快慢離子間就形成了一個缺少離子的高壓區(qū)稽穆,在高壓區(qū)內(nèi)所有的負(fù)離子都會加速移動,當(dāng)移到Cl離子區(qū)域時赶撰,高電壓消失舌镶,蛋白質(zhì)的移動速度慢下來,當(dāng)以上穩(wěn)定狀態(tài)建立后豪娜,蛋白質(zhì)樣品在快慢離子間被濃縮形成一個狹小的之間層餐胀,按照電荷大小排列,但是由于目標(biāo)蛋白都帶有負(fù)電荷瘤载,所以位于同一的起點否灾。從濃縮膠進(jìn)入分離膠后,膠的pH升高惕虑,Gly的離解度增大坟冲,泳動率上升,又因為它分子小溃蔫,故超過所有的蛋白質(zhì)分子健提,緊跟在Cl離子后,Cl離子遷移后伟叛,低離子濃度不再存在私痹,形成了恒定的電場強度,因此统刮,蛋白質(zhì)樣品在分離膠中的分離主要取決于它的電荷性質(zhì)紊遵,分子大小和形狀,分離膠的孔徑有一定大小侥蒙,對不同相對質(zhì)量的蛋白質(zhì)來說暗膜,通過時收到的滯阻作用不同,即使靜電荷相等的顆粒鞭衩,也會由于這種分子篩的效應(yīng)学搜,把不同大小的蛋白質(zhì)相互分開。
步驟:
1.配膠论衍,有分離膠和濃縮膠之分瑞佩,膠濃度隨你蛋白的大小變化而變化,一般12%坯台,一般需要兩個小時炬丸,需要提前準(zhǔn)備。短期可以充水放置于4℃冰箱蜒蕾。
2.將蛋白加入5X的SDS-loading稠炬, 100℃加熱10min焕阿,以充分變性蛋白。
3.上樣酸纲,一般10μL捣鲸。
4.濃縮膠一般80V 30min 進(jìn)入分離膠后可140V 30min。
5.結(jié)束后可用于考染或者western blot闽坡。
最后的最后? 提醒一下自己:
丙烯酰胺-甲叉丙烯酰胺(Arc-Bis):中等毒性栽惶,神經(jīng)毒劑。低濃度接觸數(shù)月數(shù)年后疾嗅,漸出現(xiàn)頭痛頭暈疲勞外厂,嗜睡,手指剌痛代承,麻木感汁蝶,常伴有兩手掌發(fā)紅,脫屑论悴,手掌足心多汗掖棉。
過硫酸銨(APS):對皮膚粘膜有刺激性和腐蝕性.吸入后引起鼻炎、喉炎膀估、氣短和咳嗽等.眼幔亥、皮膚接觸可引起強烈刺激、疼痛甚至灼傷.口服引起腹痛察纯、惡心和嘔吐.長期皮膚接觸可引起變應(yīng)性皮炎.帕棉。
SDS:對粘膜和上呼吸道有刺激作用,對眼和皮膚有刺激作用.可引起呼吸系統(tǒng)過敏性反應(yīng)。
TEMED:強神經(jīng)毒劑
記得帶上手套和口罩饼记!