簡介
FastDNA SPIN Kit for Soil的目的是從土壤樣品中提供基因組DNA供PCR使用巍棱,在不到30min內(nèi),快速DNA提取方法排除使用有害的有機溶劑蛋欣,如苯酚和氯仿航徙。該試劑盒適用于土壤環(huán)境中所有的細菌、真菌陷虎、植物和動物的基因組DNA提取到踏。
該試劑盒包括三個部分:
1、裂解
Lysing Matrix E tubes中含有的陶瓷和硅粒子尚猿,旨在有效地溶解所有不同來源的微生物窝稿,包括真細菌孢子和芽孢、革蘭氏陽性菌凿掂、酵母菌伴榔、藻類、線蟲和真菌。
2踪少、MT Buffer和Sodium Phosphate Buffer都經(jīng)過精心挑選和準備塘安,使完整的樣本同質(zhì)化和蛋白增溶,試劑能夠以最小的RNA污染提取基因組DNA援奢。
3兼犯、DNA純化和洗脫試劑
GENECLEAN過程是他們用來純化基因組DNA,程序純化DNA用專門的硅膠基質(zhì)的同時消除污染物萝究,抑制并發(fā)生反應。
*Binding Matrix懸浮
*SEWS-M(鹽乙醇洗锉罐,用前加100ml乙醇)
*DES(DNA洗脫液超純水)
試驗方案
樣品處理:
1帆竹、添加500mg的土壤到Lysing Matrix E tube;
由于FastPrep儀器的移動脓规,在管內(nèi)看到大量的聚集栽连,相同Lysing Matrix不應超過管的體積的7/8,留在管的空間侨舆,也提高了更好的同質(zhì)化的機會秒紧;【見注1】
裂解:加入978ul Sodium Phosphate Buffer和122ul MT Buffer;【見注1】
2挨下、在FastPrep儀器中混勻40s的速度6.0熔恢;
3、14000Xg離心Lysing Matrix E tubes 5-10min臭笆;【見注2】
4叙淌、上清轉(zhuǎn)移到一個干凈的2.0ml管中,加入250ul PPS試劑后混合愁铺,用手搖動管10次鹰霍;
5、14000Xg離心5min沉淀茵乱,上清轉(zhuǎn)移到一個干凈的15ml管中茂洒,上清液加入1ml Binding Matrix Supension;(Binding Matrix在用之前重懸均勻)
6瓶竭、放在一個旋轉(zhuǎn)器或者
手工反轉(zhuǎn)2min督勺,讓DNA結(jié)合基質(zhì),將管放架上靜置3min斤贰,讓硅膠基質(zhì)沉淀玷氏;
7、小心去除500ul上清腋舌,避免碰到沉淀的Binding Matrix盏触,棄上清,約600ul的混合物轉(zhuǎn)移到SPINTMFilter,14000Xg離心1min赞辩,倒空Catch Tube雌芽,并把剩下的上清加到SPINTMFilter中離心過濾;
8辨嗽、添加500ul SEWS-M到SPINTM Filter世落,離心1min,再14000Xg糟需,倒出濾過液并把SPINTM Filter放回Catch Tube屉佳,14000Xg離心2min,在清干SPINTM Filter中的剩余EWS-M洲押;
9武花、移動SPINTM Filter到新的Catch Tube,室溫下風干5min杈帐;
10体箕、加入50-100ul DES,輕輕的重懸挑童,輕輕攪動濾膜用槍頭或渦流/手指輕彈累铅,重懸為高效的DNA洗脫二氧化硅矩陣,再14000Xg離心1min站叼,轉(zhuǎn)移洗脫的DNA到Catch Tube娃兽。
注釋
請在進行提取之前閱讀FastPrep DNA
【注1】:留下約0.25cc的空氣空間,如果留下太少的空氣空間尽楔,可能導致樣品的損失换薄,由于管故障或者變形,樣品的損失是FastPrep運行期間由于溫度升高使壓力增加翔试,在管內(nèi)預留0.25cc的空氣空間轻要,足夠防止FastPrep運行期間造成的損失;
【注2】:旋轉(zhuǎn)15min垦缅,可增強消除從大量的樣品或從復雜的細胞壁的細胞產(chǎn)生的過多的碎片冲泥。
FastDNA SPIN Kit for Soil土壤DNA快速提取試劑盒提取步驟:
https://wenku.baidu.com/view/ad0bff1933d4b14e8424684b.html