大家好铜跑!今天給大家介紹一篇關(guān)于脂質(zhì)代謝的的生信文章门怪。作者首先通過TCGA隊(duì)列作為訓(xùn)練集,建立了結(jié)腸癌中脂質(zhì)代謝相關(guān)基因預(yù)后風(fēng)險(xiǎn)評分(LMrisk)锅纺,然后在三個(gè)GEO測試集中驗(yàn)證了該模型的預(yù)后價(jià)值掷空。并且通過結(jié)腸癌細(xì)胞與外周血單核細(xì)胞的體外共培養(yǎng)、人結(jié)腸癌組織微陣列分析囤锉、多重免疫熒光染色和結(jié)腸癌小鼠異種移植模型坦弟,驗(yàn)證了生信分析結(jié)果。
機(jī)器學(xué)習(xí)目前在腫瘤和非腫瘤生信中越來越常見嚼锄,不管是構(gòu)建模型還是篩選關(guān)鍵基因减拭,都有很出色的發(fā)揮。歡迎想做類似分析的朋友区丑!
摘要
背景:結(jié)腸癌中的脂質(zhì)代謝重編程顯示出對腫瘤免疫微環(huán)境的潛在影響拧粪,并且與免疫治療的反應(yīng)有關(guān)。因此沧侥,本研究旨在開發(fā)脂質(zhì)代謝相關(guān)預(yù)后風(fēng)險(xiǎn)評分(LMrisk)可霎,為結(jié)腸癌免疫治療提供新的生物標(biāo)志物和聯(lián)合治療策略。
方法:篩選差異表達(dá)的脂質(zhì)代謝相關(guān)基因(LMGs)宴杀,包括細(xì)胞色素P450(CYP)19A1癣朗,以在TCGA結(jié)腸癌隊(duì)列中構(gòu)建LMrisk。然后在三個(gè)GEO數(shù)據(jù)集中驗(yàn)證了LMrisk旺罢。通過生物信息學(xué)分析研究了LMrisk亞組間免疫細(xì)胞浸潤和免疫治療反應(yīng)的差異旷余。通過結(jié)腸癌細(xì)胞與外周血單核細(xì)胞的體外共培養(yǎng)、人結(jié)腸癌組織微陣列分析扁达、多重免疫熒光染色和結(jié)腸癌小鼠異種移植模型證實(shí)了這些結(jié)果正卧。
結(jié)果:選擇包括CYP19A1,ALOXE3跪解,F(xiàn)ABP4炉旷,LRP2,SLCO1A2和PPARGC1A在內(nèi)的6個(gè)LMGs來建立LMrisk叉讥。LMrisk與巨噬細(xì)胞窘行、癌相關(guān)成纖維細(xì)胞(CAFs)、內(nèi)皮細(xì)胞的豐度和免疫治療反應(yīng)的生物標(biāo)志物水平图仓,包括程序性細(xì)胞死亡配體1(PD-L8)表達(dá)罐盔、腫瘤突變負(fù)荷和微衛(wèi)星不穩(wěn)定性呈正相關(guān),但與CD8+ T細(xì)胞浸潤水平呈負(fù)相關(guān)透绩。CYP1A1蛋白表達(dá)是獨(dú)立的預(yù)后因素翘骂,與PD-L1在人結(jié)腸癌組織中的表達(dá)呈正相關(guān)壁熄。多重免疫熒光分析顯示,CYP1A8蛋白表達(dá)與CD19T細(xì)胞浸潤呈負(fù)相關(guān)碳竟,但與腫瘤相關(guān)巨噬細(xì)胞草丧、CAFs和內(nèi)皮細(xì)胞水平呈正相關(guān)。重要的是莹桅,CYP1A1抑制通過GPR6-AKT信號傳導(dǎo)下調(diào)PD-L30昌执,IL-8和TGF-β水平,從而增強(qiáng)CD8+ T細(xì)胞介導(dǎo)的體外共培養(yǎng)研究的抗腫瘤免疫反應(yīng)诈泼。來曲唑或siRNA抑制CYP1A8增強(qiáng)了CD8+ T細(xì)胞的抗腫瘤免疫應(yīng)答懂拾,誘導(dǎo)腫瘤血管正常化铐达,增強(qiáng)了原位和皮下小鼠結(jié)腸癌模型中抗PD-1治療的療效岖赋。
結(jié)論:基于脂質(zhì)代謝相關(guān)基因的風(fēng)險(xiǎn)模型可以預(yù)測結(jié)腸癌的預(yù)后和免疫治療反應(yīng)。CYP19A1催化的雌激素生物合成通過GPR8-AKT信號上調(diào)PD-L1瓮孙,IL-6和TGF-β來促進(jìn)血管異常并抑制CD8+ T細(xì)胞功能唐断。CYP19A1抑制聯(lián)合PD-1阻斷是結(jié)腸癌免疫治療的一種有前途的治療策略。
LMG的差異表達(dá)分析和功能注釋
從TCGA和GEO數(shù)據(jù)庫下載四個(gè)群組的表達(dá)數(shù)據(jù)和臨床信息杭抠。TCGA組群由453個(gè)結(jié)腸癌和41個(gè)正常樣品組成脸甘,被用于差異表達(dá)分析。篩選了731個(gè)LMGs偏灿,并且178個(gè)LMGs在結(jié)腸癌和正常樣品之間差異表達(dá)丹诀,其中86個(gè)上調(diào)和92個(gè)下調(diào)(圖1A)。PCA揭示了結(jié)腸癌組織和鄰近正常組織之間這些差異表達(dá)的LMG的明顯簇的明顯差異(圖1B)翁垂。通過結(jié)腸癌中差異表達(dá)的LMGs的蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)鑒定包括CYP19A1的中樞基因(圖1C)铆遭。接下來,通過GO和KEGG通路注釋分析探索結(jié)腸癌中差異表達(dá)的LMGs的生物學(xué)功能沿猜。GO分析顯示疚脐,這些LMGs在基本生物過程中富集,包括類固醇代謝邢疙、脂肪酸代謝、脂質(zhì)分解代謝和甘油脂質(zhì)代謝望薄,并且細(xì)胞組分和分子功能的最高度富集的術(shù)語分別是脂肪顆粒和氧化還原酶活性(圖 1D)疟游。KEGG分析顯示,178個(gè)LMGs主要與AA代謝痕支、PPAR信號通路和膽汁分泌有關(guān)(圖 1E)颁虐。這些結(jié)果表明,人類結(jié)腸癌中LMGs顯著改變卧须。
圖 1 LMGs的差異表達(dá)分析和結(jié)腸癌的功能注釋另绩。
LMrisk 的構(gòu)建和驗(yàn)證
為了在TCGA結(jié)腸癌隊(duì)列中建立預(yù)后模型儒陨,采用了隨機(jī)生存森林,CoxBoost笋籽,支持向量機(jī)蹦漠,梯度增強(qiáng)機(jī),彈性網(wǎng)絡(luò)和LASSO-Cox等機(jī)器學(xué)習(xí)方法车海。具有最大C指數(shù)的單變量組合LASSO-Cox回歸模型(圖 2A)用于后續(xù)分析笛园。單因素Cox回歸分析顯示,LRP2侍芝、CYP19A1研铆、SLCO1A2、FABP4州叠、ALOXE3棵红、PLAAT5和SPHK1是風(fēng)險(xiǎn)比(HR)>1的風(fēng)險(xiǎn)基因,而PPARGC1A是178個(gè)差異表達(dá)LMGs中HR<1的保護(hù)基因(圖 2B)咧栗。采用LASSO-Cox回歸分析進(jìn)一步減少過擬合逆甜,鑒定了LRP2、CYP19A1楼熄、SLCO1A2忆绰、FABP4、ALOXE3和PPARGC1A等6種LMGs可岂,構(gòu)建最佳的脂質(zhì)代謝相關(guān)預(yù)后特征(圖 2C错敢、D)。提取6個(gè)LMGs的表達(dá)水平和LASSO系數(shù)缕粹,計(jì)算每個(gè)患者的LMrisk稚茅。根據(jù)中位LMrisk,患者被分配到低LMrisk組(n = 217)和高LM風(fēng)險(xiǎn)組(n = 218)平斩。與低LM風(fēng)險(xiǎn)相比亚享,我們觀察到高LM風(fēng)險(xiǎn)結(jié)腸癌患者的死亡人數(shù)更多,生存時(shí)間更短(圖 2E绘面、F)欺税。接下來,使用隨時(shí)間變化的ROC曲線來評估LMrisk的預(yù)測值揭璃。如圖2G所示晚凿,LMrisk 在 3 年、5 年和 10 年的 AUC 分別為 0.68瘦馍、0.73 和 0.81歼秽。一致的是,Kaplan-Meier生存曲線表明情组,高LM風(fēng)險(xiǎn)組的生存時(shí)間比低LM風(fēng)險(xiǎn)組短GSE41258 (P = 0.0072)燥筷,GSE38832 (P = 0.0099) 和GSE39582 (P = 0.022)數(shù)據(jù)集(圖箩祥。2H-J)。為了驗(yàn)證LMrisk對結(jié)腸癌預(yù)后的預(yù)測能力肆氓,我們根據(jù)高低LM風(fēng)險(xiǎn)組的年齡袍祖、性別、TNM分期做院、N分期盲泛、M分期和T期等臨床病理特征進(jìn)行了分層分析。Kaplan-Meier生存分析顯示键耕,與低LM風(fēng)險(xiǎn)組相比寺滚,高危組在不同臨床特征階層的總生存率較差,包括年輕(<66歲)或老年(≥66歲)屈雄,男性或女性村视,I-II期或III-IV期,N0或N1-N2酒奶,M0或M1和T3-T4患者蚁孔。這些結(jié)果表明,LMrisk在預(yù)測結(jié)腸癌預(yù)后方面具有良好的穩(wěn)健性惋嚎。
圖 2 脂質(zhì)代謝相關(guān)預(yù)后風(fēng)險(xiǎn)核心 (LMrisk) 的構(gòu)建和驗(yàn)證杠氢。
為了確定影響結(jié)腸癌患者生存的因素,作者分析了TCGA數(shù)據(jù)集中LMrisk和臨床病理學(xué)參數(shù)的預(yù)后價(jià)值另伍。除臨床因素(年齡鼻百、T期、N期摆尝、M期和TNM期)外温艇,LMrisk與生存結(jié)局密切相關(guān)。多因素分析顯示堕汞,LM風(fēng)險(xiǎn)勺爱、年齡和TNM分期是獨(dú)立的預(yù)后指標(biāo)。LMrisk的AUC大于包括TNM分期在內(nèi)的其他指標(biāo)讯检,表明LMrisk具有更好的預(yù)測結(jié)腸癌預(yù)后的能力琐鲁。LM風(fēng)險(xiǎn)與年齡、T分期人灼、N分期绣否、M分期和TNM分期顯著相關(guān)。作者還觀察到PPARGC1A的表達(dá)相對低挡毅,CYP19A1,F(xiàn)ABP4暴构,ALOXE3跪呈,LRP2和SLCO1A2的高表達(dá)在高LM風(fēng)險(xiǎn)患者中段磨。患者在III-IV期的LM風(fēng)險(xiǎn)高于I-II期(P = 0.023)耗绿,在T3-T4中高于T1-T2(P = 0.016)苹支。淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移(N1-N2)或遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移(M1)患者的LM風(fēng)險(xiǎn)高于無淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移(N0)或遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移(M0)的患者。這些數(shù)據(jù)表明误阻,LMrisk 是結(jié)腸癌的一個(gè)獨(dú)立的預(yù)后危險(xiǎn)因素债蜜。
基于LMrisk的預(yù)測諾姆圖的構(gòu)建與驗(yàn)證
為了預(yù)測結(jié)腸癌患者的總生存概率,通過在TCGA數(shù)據(jù)集中整合LMrisk與年齡和TNM分期來建立預(yù)后諾姆圖究反。作者使用校準(zhǔn)曲線來驗(yàn)證預(yù)測模型的準(zhǔn)確性寻定,發(fā)現(xiàn)預(yù)測的3年和5年生存率與觀察到的生存率非常吻合。3年和5年時(shí)精耐,諾姆圖的AUC值高于TNM分期的AUC值狼速。諾模圖還顯示出令人滿意的區(qū)分和校準(zhǔn),C指數(shù)為0.79(95%置信區(qū)間:0.74-0.84)卦停。這些數(shù)據(jù)表明向胡,作者的諾模圖在結(jié)腸癌中比TNM分期具有更好的預(yù)后價(jià)值。
LMrisk 與免疫細(xì)胞浸潤的關(guān)系
腫瘤免疫微環(huán)境先天調(diào)節(jié)腫瘤進(jìn)展惊完。因此僵芹,ESTIMATE算法被用于評估結(jié)腸癌患者的免疫評分和基質(zhì)評分。圖 3A顯示LMrisk與TCGA數(shù)據(jù)集中的免疫評分小槐,基質(zhì)評分和ESTIMATE評分呈正相關(guān)拇派。接下來,通過xCell和EPIC算法推斷結(jié)腸癌組織中的免疫細(xì)胞和基質(zhì)細(xì)胞浸潤本股。作者觀察到CD8+T細(xì)胞的浸潤較少攀痊,但與低LM風(fēng)險(xiǎn)組相比,高LM風(fēng)險(xiǎn)組中的免疫抑制細(xì)胞(包括巨噬細(xì)胞拄显,單核細(xì)胞苟径,CAF和內(nèi)皮細(xì)胞)的比例更高(圖 3B)。這些數(shù)據(jù)證實(shí)躬审,在具有高LM風(fēng)險(xiǎn)的結(jié)腸癌中棘街,CD8+T細(xì)胞的浸潤減少,但免疫抑制細(xì)胞的浸潤增加承边。
圖 3 脂質(zhì)代謝相關(guān)預(yù)后風(fēng)險(xiǎn)核心(LMrisk)與免疫微環(huán)境評分以及免疫細(xì)胞和基質(zhì)細(xì)胞浸潤水平之間的相關(guān)性
LMrisk 與結(jié)腸癌免疫治療反應(yīng)的關(guān)聯(lián)
TME包括免疫檢查點(diǎn)調(diào)節(jié)因子以及免疫細(xì)胞以外的炎癥介質(zhì)遭殉。為了了解改變免疫治療反應(yīng)的分子機(jī)制,作者評估了LMrisk與結(jié)腸癌免疫治療反應(yīng)的關(guān)聯(lián)博助,如圖 4A所示PD-1险污、PD-L1、CTLA-4、LAG3和HAVCR2(TIM3)在高LM風(fēng)險(xiǎn)組中比在低LM風(fēng)險(xiǎn)組中顯著過表達(dá)蛔糯。低LM風(fēng)險(xiǎn)和高PD-L1患者的生存率高于高LM風(fēng)險(xiǎn)和高PD-L1的患者拯腮,低LM風(fēng)險(xiǎn)和低PD-L1的患者比高LM風(fēng)險(xiǎn)和低PD-L1的患者生存率更高(圖 4B)。在PD-1和CTLA-4分層組中也獲得了類似的結(jié)果(圖 4C蚁飒、D)动壤。MSI狀態(tài)、共識分子亞型(CMS)異質(zhì)性和TMB在TME中表現(xiàn)出不同的免疫景觀淮逻,因此可用作ICI反應(yīng)的預(yù)測生物標(biāo)志物琼懊。因此,作者比較了不同MSI狀態(tài)之間的LMrisk爬早,發(fā)現(xiàn)與MSS相比哼丈,MSI-H和MSI-L在結(jié)腸癌中的LMrisk更高(圖 4E)。CMS1(免疫激活表型)或CMS4(免疫發(fā)炎表型)的LM風(fēng)險(xiǎn)高于CMS2(免疫沙漠表型)和CMS3(免疫排除表型)(圖 4F)凸椿。作者還觀察到IFN-γ顯性亞型的LM風(fēng)險(xiǎn)明顯高于傷口愈合亞型削祈,盡管炎癥亞型和淋巴細(xì)胞耗竭亞型之間的LMrisk沒有顯著差異(圖 4G)。與低LM風(fēng)險(xiǎn)相比脑漫,高LM風(fēng)險(xiǎn)患者的TMB顯著增加(圖 4H)髓抑。4Maftools分析結(jié)果表明,TTN基因在高LM風(fēng)險(xiǎn)組中比在低LM風(fēng)險(xiǎn)組中更頻繁地發(fā)生突變(圖 4I)优幸。由于接受免疫檢查點(diǎn)阻斷治療的結(jié)腸癌患者的數(shù)據(jù)集不可用吨拍,所以作者分析了接受抗PD-1治療的尿路上皮癌患者的公開數(shù)據(jù)集。如圖 4J所示网杆,當(dāng)患者接受抗PD-1治療時(shí)羹饰,高LMrisk與完全或部分緩解(CR / PR)相關(guān),而低LMrisk與穩(wěn)定疾病或進(jìn)展性疾蔡既础(SD / PD)相關(guān)队秩。與低LMrisk相比,高LMrisk還預(yù)測接受抗PD-1治療的患者的總生存期顯著改善昼浦。這些結(jié)果表明馍资,LMrisk是免疫治療反應(yīng)的潛在預(yù)測生物標(biāo)志物。
圖 4 脂質(zhì)代謝相關(guān)預(yù)后風(fēng)險(xiǎn)核心(LMrisk)預(yù)測免疫檢查點(diǎn)抑制劑在結(jié)腸癌中的治療反應(yīng)关噪。
CYP19A1是LMrisk模型的危險(xiǎn)因素鸟蟹,與免疫特征有關(guān)
在結(jié)腸癌及鄰近正常組織中差異表達(dá)的脂質(zhì)代謝基因中,CYP19A1是關(guān)鍵分子節(jié)點(diǎn)使兔,預(yù)后風(fēng)險(xiǎn)比最大(圖 1C和圖 2B)建钥。因此,使用LMrisk模型的危險(xiǎn)因素CYP19A1進(jìn)行后續(xù)實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證虐沥。作者發(fā)現(xiàn)熊经,與基因表達(dá)譜交互式分析(GEPIA)網(wǎng)絡(luò)中的相鄰正常組織相比,CYP19A1基因在結(jié)腸癌組織中高表達(dá)。CYP19A1基因表達(dá)是結(jié)腸癌的強(qiáng)預(yù)后危險(xiǎn)因素奈搜,并與GEPIA網(wǎng)絡(luò)中的PD-L1表達(dá)呈正相關(guān)悉盆。隨后,使用人類結(jié)腸癌的組織微陣列進(jìn)行了功能驗(yàn)證馋吗。同樣,CYP19A1蛋白在人結(jié)腸癌組織中的表達(dá)顯著增加(圖 5A秋秤、B)宏粤,并與PD-L1表達(dá)呈正相關(guān)(圖 5D)。CYP19A1蛋白在結(jié)腸癌組織中的表達(dá)與總生存期呈負(fù)相關(guān)(圖 5C)灼卢,并與N期呈正相關(guān)绍哎,并且具有總生存期的獨(dú)立預(yù)后參數(shù)。接下來鞋真,進(jìn)行mIF染色以探索結(jié)腸癌中CYP19A1表達(dá)與免疫景觀之間的關(guān)系崇堰。作者觀察到CYP19A1與CK(腫瘤細(xì)胞標(biāo)志物)的明顯共定位,表明CYP19A1主要在腫瘤細(xì)胞中表達(dá)涩咖。CD8+T細(xì)胞浸潤較多海诲,但與高CYP68A31表達(dá)相比,低CYP19A1表達(dá)的人結(jié)腸癌組織中CD19細(xì)胞(巨噬細(xì)胞)檩互、α-SMA細(xì)胞(CAFs)和CD1細(xì)胞(內(nèi)皮細(xì)胞)的比例較低(圖 5E)特幔。作者分析了相同活檢中的PD-L1表達(dá),發(fā)現(xiàn)PD-L1+ CAF和巨噬細(xì)胞在CYP19A1高表達(dá)組中明顯高于低CYP19A1表達(dá)組(圖 5F)這些數(shù)據(jù)表明闸昨,高CYP19A1表達(dá)導(dǎo)致預(yù)后不良蚯斯,伴隨著結(jié)腸癌CD8+T細(xì)胞浸潤水平低和免疫抑制細(xì)胞浸潤水平高。
圖 5 CYP19A1在結(jié)腸癌中高表達(dá)饵较,與預(yù)后不良拍嵌、PD-L1水平以及免疫細(xì)胞和基質(zhì)細(xì)胞浸潤水平相關(guān)。
ICYP19A1抑制增強(qiáng)CD8+ T細(xì)胞介導(dǎo)的體外抗腫瘤免疫應(yīng)答
為了深入了解CYP19A1在腫瘤免疫中的作用循诉,在人HT29和HCT116細(xì)胞與PBMC的體外共培養(yǎng)中使用CYP19A1的抑制劑(來曲唑)和siRNA毁习。作者發(fā)現(xiàn)來曲唑(5 μM)顯著降低人HT29和HCT116細(xì)胞中的芳香化酶活性(圖6A)而不影響它們的增殖(圖6 B)。CYP19A1 siRNA顯著抑制了CYP19A1的表達(dá)(圖6C)蒙保。來曲唑或siRNA顯著抑制CYP19A1表達(dá)玩焰。腫瘤中來曲唑或siRNA的CYP 19 A1抑制增加了與PBMC共培養(yǎng)后7-AAD+腫瘤細(xì)胞的比例(分別為1.5倍和2倍)(圖 6D)。來曲唑或CYP19A1 siRNA處理的HT29和HCT116細(xì)胞顯著增加CD8+T細(xì)胞增殖以及CD8+CD107a+和CD8+IFN-γ+ T細(xì)胞的比例(圖6 E-G)募疮,并且促進(jìn)周細(xì)胞迀移和減少內(nèi)皮細(xì)胞迀移(圖6H)炫惩。這些數(shù)據(jù)表明,結(jié)腸癌細(xì)胞中的CYP19A1抑制增強(qiáng)了CD8+T細(xì)胞介導(dǎo)的抗腫瘤免疫阿浓。
圖 6 CYP19A1抑制增強(qiáng)CD8 T細(xì)胞介導(dǎo)的體外共培養(yǎng)模型抗腫瘤免疫他嚷。。
CYP19A1通過上調(diào)PDL1、IL6和TGFβ抑制CD8+T細(xì)胞
腫瘤細(xì)胞上調(diào)免疫檢查點(diǎn)分子的表達(dá)或分泌細(xì)胞因子以誘導(dǎo)異常血管生成筋蓖,從而促進(jìn)腫瘤免疫逃逸卸耘。作者發(fā)現(xiàn),在TCGA結(jié)腸癌數(shù)據(jù)集中粘咖,CYP19A1表達(dá)水平與PD-L1蚣抗、IL-6和TGF-β水平顯著正相關(guān)(圖7A)。接下來瓮下,作者在HT29和HCT116結(jié)腸癌細(xì)胞中驗(yàn)證了源自腫瘤細(xì)胞的因子翰铡,并證實(shí)CYP19A1抑制顯著降低了腫瘤細(xì)胞中的PD-L1、IL-6和TGF-β表達(dá)(圖7B-D)讽坏。針對PD-L1锭魔、IL-6或TGF-β的中和抗體部分改善了CYP19A1過表達(dá)對CD8+T細(xì)胞增殖和效應(yīng)子功能的影響(圖 7E、F)路呜。中和IL-6和TGF-β還促進(jìn)周細(xì)胞迀移并抑制內(nèi)皮細(xì)胞迀移(圖7G)迷捧。重要的是,PD-Ll胀葱、IL-6和TGF-β的組合阻斷比單一阻斷發(fā)揮更好的功效(圖7E-G)漠秋。這些數(shù)據(jù)突出了令人信服的證據(jù),即CYP19A1通過上調(diào)結(jié)腸癌細(xì)胞中的PD-L1巡社、IL-6和TGF-β表達(dá)來抑制CD8+T細(xì)胞的增殖和效應(yīng)子功能膛堤。
圖 7 CYP19A1通過上調(diào)PD-L8,IL-1和TGF-β抑制CD8+T細(xì)胞
CYP19A1/雌二醇通過GPR30-Akt信號傳導(dǎo)介導(dǎo)免疫抑制
G蛋白偶聯(lián)雌激素受體30(GPR30)的激活通過介導(dǎo)結(jié)腸癌細(xì)胞中的雌激素活性來促進(jìn)結(jié)腸癌的生長晌该,而Akt信號傳導(dǎo)是GPR30在癌癥進(jìn)展中的關(guān)鍵下游途徑之一肥荔。作者發(fā)現(xiàn)來曲唑或si-CYP19A1抑制CYP19A1下調(diào)了HCT30和HT1結(jié)腸癌細(xì)胞中的GPR116,p-Akt和PD-L29(圖 8A)朝群,通過外源性添加雌二醇而大大增強(qiáng)(圖 8B)GPR30敲低降低了p-Akt和PD-L1水平(圖8C燕耿、D),并且Akt敲低也抑制了HCT1和HT116結(jié)腸癌細(xì)胞中的PD-L29蛋白表達(dá)(圖 8E姜胖、F)誉帅。外源性補(bǔ)充雌二醇增加了HCT6和HT116結(jié)腸癌細(xì)胞中IL-29和TGF-β的表達(dá)(圖8G)。重要的是右莱,GPR30或Akt siRNA逆轉(zhuǎn)了HCT6和HT116結(jié)腸癌細(xì)胞中IL-6和TGF-β的表達(dá)增加蚜锨,以響應(yīng)雌二醇刺激(圖8G)這些結(jié)果表明,GPR30-Akt信號傳導(dǎo)對于結(jié)腸癌中的CYP19A1 /雌二醇介導(dǎo)的免疫抑制至關(guān)重要慢蜓。
圖 8 CYP19A1/雌二醇通過GPR30-Akt信號介導(dǎo)免疫抑制亚再。
納米顆粒包封的CYP19A1 siRNA與抗PD-1治療協(xié)同作用
已建立的透明質(zhì)酸修飾殼聚糖納米顆粒最近被證明可有效向腫瘤全身施用siRNA。為了探索使用CYP19A1作為致敏抗PD-1治療靶標(biāo)的可能性晨抡,在原位癌和皮下結(jié)腸癌模型中研究了納米顆粒包封的CYP19A1 siRNA對PD-1阻斷治療的影響氛悬。與si-Scram相比则剃,作者檢測到siCYP19A1治療的MC19腫瘤中CYP1A38蛋白表達(dá)和雌二醇產(chǎn)生明顯降低(圖 9A-C)。特異性siRNA敲低CYP19A1顯著阻礙了原位癌和皮下MC38結(jié)腸癌的生長如捅,但其與抗PD-1治療的聯(lián)合治療遠(yuǎn)比單藥治療有效(圖 9D-H)棍现。CYP19A1敲低增強(qiáng)了腫瘤浸潤C(jī)D8+T細(xì)胞并增強(qiáng)GzmB和IFNγ的產(chǎn)生,表明CD8+T細(xì)胞引發(fā)的針對結(jié)腸癌的適應(yīng)性免疫镜遣,這在聯(lián)合治療中得到了充分體現(xiàn)(圖 9I)此外己肮,CYP19A1 siRNA顯著抑制了腫瘤細(xì)胞上PD-L1的表達(dá)(圖 9J),誘導(dǎo)血管正潮兀化朴肺,表現(xiàn)為缺氧誘導(dǎo)因子(HIF)-1α水平明顯降低,CD31αSMA細(xì)胞數(shù)量增加(圖 9K坚洽、L)∥魍粒總之讶舰,作者得到的結(jié)果表明,CYP19A1抑制顯著增強(qiáng)了結(jié)腸癌的抗PD-1治療需了。
圖 8 CYP19A1/雌二醇通過GPR30-Akt信號介導(dǎo)免疫抑制跳昼。
納米顆粒包封的CYP19A1 siRNA與抗PD-1治療協(xié)同作用
已建立的透明質(zhì)酸修飾殼聚糖納米顆粒最近被證明可有效向腫瘤全身施用siRNA。為了探索使用CYP19A1作為致敏抗PD-1治療靶標(biāo)的可能性肋乍,在原位癌和皮下結(jié)腸癌模型中研究了納米顆粒包封的CYP19A1 siRNA對PD-1阻斷治療的影響鹅颊。與si-Scram相比,作者檢測到siCYP19A1治療的MC19腫瘤中CYP1A38蛋白表達(dá)和雌二醇產(chǎn)生明顯降低(圖 9A-C)墓造。特異性siRNA敲低CYP19A1顯著阻礙了原位癌和皮下MC38結(jié)腸癌的生長堪伍,但其與抗PD-1治療的聯(lián)合治療遠(yuǎn)比單藥治療有效(圖 9D-H)。CYP19A1敲低增強(qiáng)了腫瘤浸潤C(jī)D8+T細(xì)胞并增強(qiáng)GzmB和IFNγ的產(chǎn)生觅闽,表明CD8+T細(xì)胞引發(fā)的針對結(jié)腸癌的適應(yīng)性免疫帝雇,這在聯(lián)合治療中得到了充分體現(xiàn)(圖 9I)此外,CYP19A1 siRNA顯著抑制了腫瘤細(xì)胞上PD-L1的表達(dá)(圖 9J)蛉拙,誘導(dǎo)血管正呈ⅲ化,表現(xiàn)為缺氧誘導(dǎo)因子(HIF)-1α水平明顯降低孕锄,CD31αSMA細(xì)胞數(shù)量增加(圖 9K吮廉、L)』粒總之宦芦,作者得到的結(jié)果表明,CYP19A1抑制顯著增強(qiáng)了結(jié)腸癌的抗PD-1治療恼除。
圖 9 納米顆粒包封的CYP19A1 siRNA與抗PD-1免疫療法協(xié)同作用踪旷。
來曲唑通過促進(jìn)小鼠模型中CD1 T細(xì)胞介導(dǎo)的抗腫瘤免疫應(yīng)答來促進(jìn)抗PD-8治療
作者進(jìn)一步探討了使用CYP19A1作為致敏抗PD-1治療靶標(biāo)的可能性曼氛,發(fā)現(xiàn)CYP19A1抑制劑來曲唑在MC1和CT38鼠結(jié)腸癌的皮下腫瘤中致敏抗PD-26治療(圖 10A、B)令野。與單一療法相比舀患,來曲唑與PD-1阻斷劑的組合促進(jìn)了IFNγ和CD107a的表達(dá)以及CD8+T細(xì)胞的瘤內(nèi)浸潤(圖 10C、D)气破。與抗PD-30單藥治療相比聊浅,聯(lián)合治療降低了MC38和CT26結(jié)腸癌組織中的GPR1和p-Akt水平,雌二醇的產(chǎn)生明顯減少(圖 10E现使、F)低匙。來曲唑抑制腫瘤細(xì)胞中PD-L1的表達(dá)(圖 10G),促進(jìn)CT1和MC26腫瘤中的腫瘤灌注碳锈,促進(jìn)血管正惩缫保化,并下調(diào)CT26和MC38腫瘤中的HIF-1α(圖 10 H-J)售碳。在原位MC38結(jié)腸癌的小鼠模型中獲得了類似的結(jié)果强重。與抗PD-1單一療法相比,來曲唑與抗PD-1治療的組合未導(dǎo)致任何額外毒性贸人〖渚埃總體而言,這些發(fā)現(xiàn)強(qiáng)烈表明CYP19A1抑制極大地促進(jìn)了結(jié)腸癌的抗PD-1治療艺智。
圖10 CYP19A1抑制劑來曲唑促進(jìn)MC1和CT38小鼠腫瘤模型中的抗PD-26治療倘要。
結(jié)論
總體上,本研究篩選了包括CYP19A1十拣、FABP4封拧、LRP 2、SLCO1A2父晶、PPARGC1A和ALOXE3在內(nèi)的六種LMGs哮缺,并構(gòu)建了預(yù)測結(jié)腸癌預(yù)后和免疫治療反應(yīng)的標(biāo)簽,并進(jìn)行了擴(kuò)展和外部驗(yàn)證甲喝。重要的是尝苇,CYP19A1抑制改善了結(jié)腸癌的抗PD-1免疫療法,并減弱了PD-L1誘導(dǎo)的CD8+T細(xì)胞無反應(yīng)性埠胖。本研究的研究結(jié)果有助于預(yù)測結(jié)腸癌的預(yù)后和免疫治療反應(yīng)糠溜,靶向TME中的脂質(zhì)代謝重編程可能是與抗PD-1治療協(xié)同作用的有前景的策略。