基因組測序击蹲、蛋白質(zhì)組學(xué)等分子圖譜技術(shù)已經(jīng)改變了生物醫(yī)學(xué)研究，但這些技術(shù)大多需要組織分離婉宰，導(dǎo)致組織形態(tài)和空間信息的丟失歌豺。空間分子圖譜技術(shù)的最新發(fā)展使得細(xì)胞能夠在保持其空間和形態(tài)完整的情況下進(jìn)行全面的分子表征心包。分子圖譜數(shù)據(jù)生成細(xì)胞的遺傳类咧、轉(zhuǎn)錄和蛋白質(zhì)組事件的深層特征，而組織圖像捕獲細(xì)胞的空間位置蟹腾、組織和相互作用及其形態(tài)特征痕惋。這些數(shù)據(jù)，連同細(xì)胞和組織成像數(shù)據(jù)娃殖，為研究組織異質(zhì)性和細(xì)胞空間組織提供了前所未有的機(jī)會值戳。這篇綜述的目的是提供這些空間分子圖譜技術(shù)的最新發(fā)展概況和相應(yīng)的計算方法發(fā)展來分析這些數(shù)據(jù)。
面向成像和序列的空間分子分析技術(shù)的工作流程概述炉爆。由于每一種方法在技術(shù)細(xì)節(jié)上有所不同堕虹，圖只打算給出一個演示的想法。(A)組織切片叶洞。(B)雜化階段鲫凶。蛋白質(zhì)或rna與金屬偶聯(lián)抗體或熒光探針雜交。(C)量化階段衩辟。金屬同位素或熒光序列被定量讀出MS或顯微鏡螟炫。(D)條碼技術(shù)階段。RNA分子被條形碼表面探針捕獲艺晴。(E)測序的階段昼钻。合成了cDNA文庫并進(jìn)行了測序。(F)將空間轉(zhuǎn)錄數(shù)據(jù)可視化為熱圖封寞。
空間轉(zhuǎn)錄數(shù)據(jù)的應(yīng)用綜述然评。(A)鑒定SV基因。(B)將SV基因聚類成模式狈究。(C)空間細(xì)胞細(xì)胞相互作用分析碗淌。(D)將圖像數(shù)據(jù)與空間轉(zhuǎn)錄數(shù)據(jù)集成，用于下游功能分析抖锥。
