CRISPR-Cas9 的 gRNA怎么設(shè)計蝇刀?實驗怎么做?

1. 細菌 Cas9 的原理

(1) 原始狀態(tài)

cas9_3.png

(2) 改造后的狀態(tài)

cas9_4.png

(3) 如何編輯 genomic DNA

cas9_5.png

其中 依賴DNA Binding Proteins 的技術(shù)有:


DNA_BP.png

蛋白特異性結(jié)合DNA后徘溢,

(4) 基因操作技術(shù)

  • DNA 測序
  • 限制性內(nèi)切酶
  • PCR
  • Genome editing

(5) CRISPR-Cas9 技術(shù)

cas9_6.png

(6) Genome editing using CRISPR-Cas9

genome_editing.png

藍色是自己設(shè)計的20bp的gRNA序列吞琐;
而切割位點在NGG的上游某個位置,_-20bp之間然爆。

  • 細菌中站粟,Cas9蛋白精確的平端切割位點位于PAM上游3個核苷酸位置,形成平末端產(chǎn)物曾雕。

有兩種修復(fù)切口的方法:

  • 自然修復(fù)
  • 提供一個外源 template DNA序列奴烙,兩端和切口配對,中間靠DNA修復(fù)機制剖张。


    insertion.png

切口位置:

cut_site.png

(7) CRISPR-Cas as a genome editing toolbox

toolbox.png

主要有2個使用方法:

  • 基因編輯
  • DNA結(jié)合蛋白切诀,用于操縱基因組:把切割domain替換為其他分子,
    • 比如啟動子來做過表達搔弄,
    • GFP來定位基因組三維結(jié)構(gòu)幅虑。

2. 一個植物敲除的例子

一個載體上2個gRNA的例子。


cas9_1.png
cas9_2.png

3. 更多研究

(1) Testing in vivo editing using SaCas9

幾乎每種微生物都有自己的Cas9版本顾犹,大小和序列都不一樣倒庵。
切割效率也不一樣。體內(nèi)測試切割效率蹦渣。


SaCas9.png

(2) CRISPR 系統(tǒng)的分類

Cas9_classes.png

(3) 如果編輯RNA呢哄芜?

edit_RNA.png

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