Magnussen 1993 ARI NN

  1. Magnussen S. Bias in genetic variance estimates due to spatial autocorrelation. Theor. Appl. Genet. 1993;86:349–55.

遺傳田間試驗(yàn)分析的一個(gè)中心問(wèn)題是“遺傳”和“環(huán)境”效應(yīng)的二分法箕肃,因?yàn)橐粋€(gè)不能被定義為沒(méi)有另一個(gè)许溅。來(lái)自768,000個(gè)完全隨機(jī)區(qū)組設(shè)計(jì)的模擬家族試驗(yàn)的結(jié)果表明橄碾,當(dāng)表型觀察與一級(jí)自回歸(AR1)過(guò)程相容時(shí)啸驯,來(lái)自多單位小區(qū)設(shè)計(jì)的家族方差分量的估計(jì)中存在嚴(yán)重向上偏差酷师。家族方差的膨脹纱注,因此腮猖,加性遺傳方差和狹義的個(gè)體遺傳性在AR1過(guò)程中隨著最近鄰相關(guān)性(ρ)的增加而指數(shù)地進(jìn)行狸棍。通貨膨脹率的顯著差異在各種小區(qū)配置中持續(xù)存在身害。在ρ= 0.2時(shí),家庭差異的通貨膨脹率達(dá)到48-73%草戈。通貨膨脹率與遺傳性水平無(wú)關(guān)塌鸯。修改的Papadakis最近鄰(NN)調(diào)整程序測(cè)試他們消除家庭方差偏差的能力√破基于Mead的植物間相互作用系數(shù)的NN-調(diào)整和來(lái)自Bartlett的同時(shí)自回歸方案的NN-調(diào)整去除了由表型相關(guān)性引入的高達(dá)97%的偏差丙猬。 NN調(diào)整的估計(jì)比未調(diào)整的估計(jì)略高(5-8%)的相對(duì)誤差。


介紹
在田間試驗(yàn)中的最近鄰(NN)共享一個(gè)共同的微環(huán)境牵触,它傾向于使非競(jìng)爭(zhēng)鄰居的觀察結(jié)果與隨機(jī)選擇的試驗(yàn)觀察結(jié)果更相似(Cliff和Ord 1981; Upton和Fingleton 1985)淮悼。已知相鄰實(shí)驗(yàn)單元之間缺乏獨(dú)立性導(dǎo)致估計(jì)處理效果和處理對(duì)比的標(biāo)準(zhǔn)誤差的偏差(Binns 1987; Kempton和Howes 1981; Magnussen 1990; Wilkinson等人1983);它也膨脹了點(diǎn)間方差(Magnussen 1989a; Smitth 1938; Snedecor和Cochran 1971)。今天揽思,田間試驗(yàn)的分析者喜歡大量的空間方法和[NN調(diào)整技術(shù)袜腥,可以提高現(xiàn)場(chǎng)實(shí)驗(yàn)的精度和精度(例如,Corllll和Anderson 1983; Cullis和Gleeson 1989; Ord 1975 ; Stein和Corsten 1991; Zimmerman和Harville 1991)钉汗。盡管這種進(jìn)展和懷疑遺傳學(xué)試驗(yàn)中空間相關(guān)觀察的常規(guī)分析可能是災(zāi)難性的(Stroup和Mulitze 1991)羹令,但是很少有系統(tǒng)地量化NN相關(guān)觀察對(duì)估計(jì)的影響的遺傳變異。在這一領(lǐng)域取得進(jìn)展的主要障礙是植根于任何試驗(yàn)中遺傳和環(huán)境影響的混雜(Gregorius和Namkoong 1987)损痰。估計(jì)的“遺傳效應(yīng)”以參考群體和參考環(huán)境為條件福侈,反之亦然(Monserud和Rehfeldt 1990)。面對(duì)田間試驗(yàn)中一階近鄰之間的正相關(guān)卢未,如何將表型觀察分解成正交和無(wú)偏的“遺傳”和“環(huán)境”效應(yīng)的問(wèn)題變得復(fù)雜肪凛。這里提出的研究旨在通過(guò)模擬建立表型一級(jí)自回歸(ARI)過(guò)程對(duì)完全隨機(jī)區(qū)組設(shè)計(jì)中家族方差分量估計(jì)的影響。經(jīng)驗(yàn)相關(guān)模式似乎與這種類(lèi)型的過(guò)程兼容(Besag和Kempton 1986; Binns 1987; Magnussen 1990)辽社。模擬中包括的設(shè)計(jì)是在森林遺傳學(xué)試驗(yàn)中最常遇到的那些伟墙,其中空間依賴(lài)性的問(wèn)題是特別麻煩的,因?yàn)榇罅織l目滴铅,斑塊狀微網(wǎng)格馬賽克和測(cè)試的長(zhǎng)時(shí)間允許出現(xiàn)明顯的空間相互關(guān)系(Correll和Cellier 1987; Libby和Cockerham 1980; Stern 1965)戳葵。將引入可行的(不一定是最優(yōu)的)NN調(diào)整程序的選擇,并評(píng)估其消除由表型值的相關(guān)性引起的家族方差分量中的偏差的能力汉匙。

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