很多人都想學(xué)習(xí)生信數(shù)據(jù)分析仗颈，可是看到要掌握和學(xué)習(xí)Linux挨决、Python订歪、C語(yǔ)言、各種軟件/工具包刷晋、算法...往往還未入門就已經(jīng)被勸退了。
是否有對(duì)小白友好的入門方式喻奥？
與其從陌生的系統(tǒng)撞蚕、語(yǔ)言甥厦、工具入門寇钉，不如試試從現(xiàn)成的數(shù)據(jù)庫(kù)開(kāi)始...CNGBdb新上線的單細(xì)胞組學(xué)平臺(tái)（CDCP）摧莽，就十分適合0代碼基礎(chǔ)小白入門單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析镊辕。
目前，CDCP集成了CNGBdb平臺(tái)的單細(xì)胞數(shù)據(jù)資源（包括6302個(gè)樣本和321782個(gè)細(xì)胞）石咬，為用戶提供單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析鬼悠、可視化、下載和遞交功能焕窝。
通過(guò)使用CDCP入門單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析
01?了解數(shù)據(jù)
# 要分析的數(shù)據(jù)是怎樣的它掂？
用戶可通過(guò)CDCP首頁(yè)展示的物種及器官分類信息快速找到相關(guān)數(shù)據(jù)，也可以通過(guò)Explore頁(yè)面根據(jù)物種榕茧、組織用押、疾病只恨、建庫(kù)方式等條件搜索相關(guān)數(shù)據(jù)抬虽。下載并了解單細(xì)胞數(shù)據(jù)的一般格式阐污、類型等笛辟。
02?了解數(shù)據(jù)的分析流程
# 單細(xì)胞數(shù)據(jù)的一般分析流程和常用分析工具有哪些手幢？
CDCP已與生命大數(shù)據(jù)可信計(jì)算平臺(tái)CODEPLOT連通围来，用戶可通過(guò)CDCP首頁(yè)導(dǎo)航欄的Analysis按鈕進(jìn)入CODEPLOT监透，了解單細(xì)胞數(shù)據(jù)的一般分析流程及其參數(shù)，并可使用已部署的在線工具完成完整的單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析流程院刁。
03?了解數(shù)據(jù)分析結(jié)果
# 單細(xì)胞數(shù)據(jù)的分析結(jié)果是什么樣的任岸？
CDCP可對(duì)數(shù)據(jù)庫(kù)中的數(shù)據(jù)資源進(jìn)行可視化展示狡刘，包括tSNE細(xì)胞降維圖颓帝、不同類型細(xì)胞聚類分析圖购城、不同類型細(xì)胞數(shù)量柱狀圖瘪板，同時(shí)選擇單個(gè)或多個(gè)表達(dá)基因還可展示基因在不同類型細(xì)胞中表達(dá)情況的聚類圖和小提琴圖等漆诽。
對(duì)于新手來(lái)說(shuō)，通過(guò)CDCP的功能體驗(yàn)兰英，可以快速掌握單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析的一般套路畦贸，有了這個(gè)基礎(chǔ)再去學(xué)習(xí)系統(tǒng)薄坏、代碼胶坠、工具沈善、算法就沒(méi)那么困難并且會(huì)更有針對(duì)性矮瘟。
想要繼續(xù)進(jìn)階學(xué)習(xí)點(diǎn)這里 ??聽(tīng)課君送你一套單細(xì)胞課程吧澈侠！
CDCP還可以幫您存數(shù)據(jù)
用戶可根據(jù)“Submission”頁(yè)面的操作指引存儲(chǔ)單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)哨啃、表達(dá)矩陣拳球、MM坐標(biāo)矩陣祝峻、聚類文件等魔吐。
???如何在CNGBdb存儲(chǔ)單細(xì)胞數(shù)據(jù)？?
Submission頁(yè)面
此外莱找，CDCP還提供了其他單細(xì)胞數(shù)據(jù)庫(kù)的入口方便用戶使用酬姆。
CDCP訪問(wèn)地址：https://db.cngb.org/cdcp/
首發(fā)公號(hào)：國(guó)家基因庫(kù)大數(shù)據(jù)平臺(tái)??
