【科研熱點】缺氧(hypoxia)相關(guān)基因

前面給大家陸續(xù)介紹了一些科研熱點相關(guān)的基因

? m6A甲基化相關(guān)基因集

? RNA m5C甲基化相關(guān)基因列表

? 鐵死亡相關(guān)基因集

? 銅死亡相關(guān)基因集

? SCI文章中經(jīng)常出現(xiàn)的免疫相關(guān)基因集

? 科研新熱點——血管生成相關(guān)基因

?自噬相關(guān)基因集合

今天我們來聊一下另外一個熱點——缺氧(hypoxia)锰提。三位科學家發(fā)現(xiàn)了低氧誘導(dǎo)因子HIF(Hypoxia-inducible factors)以及細胞是如何感知氧氣和適應(yīng)氧氣供應(yīng)的九妈,他們發(fā)現(xiàn)了生物氧氣感知通路的機理谆棱,從而獲得了2019年諾貝爾生理學或醫(yī)學獎魔慷。

如果大家以hypoxia為關(guān)鍵詞到pubmed里面也會搜到很多相關(guān)的生信文章。下面小編就給大家列舉幾篇昔头。


2022年9月新鮮出爐的一篇發(fā)表在Frontiers in Immunology上的缺氧結(jié)合免疫構(gòu)建預(yù)后模型的文章捧灰,影響因子8.786。


今年年初發(fā)表在Frontiers in Cell and Developmental Biology上的一篇文章劲蜻,影響因子6.081陆淀。


2021年發(fā)表的一篇考余,缺氧結(jié)合免疫微環(huán)境。


2021年發(fā)表在Theranostics雜志上的一篇缺氧+治療反應(yīng)效果預(yù)測的文章轧苫,影響因子11.6分楚堤。

雖然缺氧在2019年就獲得了諾貝爾獎,但是熱度依然不減含懊。大家一定很好奇身冬,這些文章中用到的hypoxia相關(guān)的基因是從哪里搜集來的。接下來小編就帶大家找到這個gene list岔乔,帶大家上車酥筝。

在前面提到的A Prognostic Risk Score Based on Hypoxia-, Immunity-, and Epithelialto-Mesenchymal Transition-Related Genes for the Prognosis and Immunotherapy Response of Lung Adenocarcinoma這篇文章的方法部分,作者明確的提到了200個Hypoxia相關(guān)的基因來自GSEA數(shù)據(jù)庫的hallmark基因集雏门。


作者誠不欺我嘿歌,在GSEA官網(wǎng)的hallmark基因集里我找到了這200個基因,如下茁影。

PGK1
PDK1
GBE1
PFKL
ALDOA
ENO2
PGM1
NDRG1
HK2
ALDOC
GPI
MXI1
SLC2A1
P4HA1
ADM
P4HA2
ENO1
PFKP
AK4
FAM162A
PFKFB3
VEGFA
BNIP3L
TPI1
ERO1A
KDM3A
CCNG2
LDHA
GYS1
GAPDH
BHLHE40
ANGPTL4
JUN
SERPINE1
LOX
GCK
PPFIA4
MAFF
DDIT4
SLC2A3
IGFBP3
NFIL3
FOS
RBPJ
HK1
CITED2
ISG20
GALK1
WSB1
PYGM
STC1
ZNF292
BTG1
PLIN2
CSRP2
VLDLR
JMJD6
EXT1
F3
PDK3
ANKZF1
UGP2
ALDOB
STC2
ERRFI1
ENO3
PNRC1
HMOX1
PGF
GAPDHS
CHST2
TMEM45A
BCAN
ATF3
CAV1
AMPD3
GPC3
NDST1
IRS2
SAP30
GAA
SDC4
STBD1
IER3
PKLR
IGFBP1
PLAUR
CAVIN3
CCN5
LARGE1
NOCT
S100A4
RRAGD
ZFP36
EGFR
EDN2
IDS
CDKN1A
RORA
DUSP1
MIF
PPP1R3C
DPYSL4
KDELR3
DTNA
ADORA2B
HS3ST1
CAVIN1
NR3C1
KLF6
GPC4
CCN1
TNFAIP3
CA12
HEXA
BGN
PPP1R15A
PGM2
PIM1
PRDX5
NAGK
CDKN1B
BRS3
TKTL1
MT1E
ATP7A
MT2A
SDC3
TIPARP
PKP1
ANXA2
PGAM2
DDIT3
PRKCA
SLC37A4
CXCR4
EFNA3
CP
KLF7
CCN2
CHST3
TPD52
LXN
B4GALNT2
PPARGC1A
BCL2
GCNT2
HAS1
KLHL24
SCARB1
SLC25A1
SDC2
CASP6
VHL
FOXO3
PDGFB
B3GALT6
SLC2A5
SRPX
EFNA1
GLRX
ACKR3
PAM
TGFBI
DCN
SIAH2
PLAC8
FBP1
TPST2
PHKG1
MYH9
CDKN1C
GRHPR
PCK1
INHA
HSPA5
NDST2
NEDD4L
TPBG
XPNPEP1
IL6
SLC6A6
MAP3K1
LDHC
AKAP12
TES
KIF5A
LALBA
COL5A1
GPC1
HDLBP
ILVBL
NCAN
TGM2
ETS1
HOXB9
SELENBP1
FOSL2
SULT2B1
TGFB3

希望又給大家開辟了一個新的研究方向宙帝,如果覺得有用,歡迎分享給更多的同道中人募闲。

?著作權(quán)歸作者所有,轉(zhuǎn)載或內(nèi)容合作請聯(lián)系作者
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