前面小編給大家介紹過幾個研究熱點(diǎn)相關(guān)的基因集
? SCI文章中經(jīng)常出現(xiàn)的免疫相關(guān)基因集
在上一期的內(nèi)容里面但汞，我們給大家簡單的介紹了
大家應(yīng)該對m5C甲基化的概念和這個科研方向有了一定的了解界拦。
這些與科研熱點(diǎn)相關(guān)的基因集合結(jié)合分析的基本套路都是先做差異表達(dá)分析琴锭，然后跟這些熱點(diǎn)的基因集取個交集足删，繪制差異表達(dá)基因的heatmap，然后使用boxplot展示具體的基因的差異表達(dá)情況，然后再做后續(xù)分析。例如針對這些基因進(jìn)行單因素，多因素cox回歸测蘑，lasso回歸，尋找顯著跟生存相關(guān)的基因康二，然后構(gòu)建風(fēng)險評估模型碳胳。
? 一個R函數(shù)搞定風(fēng)險評估散點(diǎn)圖，熱圖
今天小編就將m5c甲基化相關(guān)的基因分享給大家沫勿。從下面這篇文章中挨约，我們就能從方法部分找到相關(guān)的基因的名字味混。
可以看到在方法部分，例舉出了13個m5C甲基化相關(guān)的基因诫惭。
為了方便大家復(fù)制粘貼翁锡，我們將13個基因的名字整理如下。
NOP2
NSUN2
NSUN3
NSUN4
NSUN5
NSUN6
NSUN7
DNMT1
DNMT3A
DNMT3B
TRDMT1
TET2
ALYREF
別看這是一篇中文paper夕土，里面的分析方法也是一個比較典型的與科研熱點(diǎn)基因集結(jié)合的純生信文章的套路馆衔。麻雀雖小五臟俱全，作為初學(xué)者還是值得好好學(xué)習(xí)的怨绣。
